Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE4

Susd6, Sushi domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd6Q8BGE4 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Susd6Q8BGE4 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Susd6Q8BGE4 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Susd6Q8BGE4 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Susd6Q8BGE4 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Susd6Q8BGE4 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Susd6Q8BGE4 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Susd6Q8BGE4 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Susd6Q8BGE4 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Susd6Q8BGE4 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Susd6Q8BGE4 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Susd6Q8BGE4 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Susd6Q8BGE4 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Susd6Q8BGE4 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Susd6Q8BGE4 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Susd6Q8BGE4 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Susd6Q8BGE4 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Susd6Q8BGE4 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Susd6Q8BGE4 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Susd6Q8BGE4 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Susd6Q8BGE4 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Susd6Q8BGE4 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Susd6Q8BGE4 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Susd6Q8BGE4 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Susd6Q8BGE4 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Susd6Q8BGE4 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Susd6Q8BGE4 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Susd6Q8BGE4 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Susd6Q8BGE4 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Susd6Q8BGE4 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Susd6Q8BGE4 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Susd6Q8BGE4 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Susd6Q8BGE4 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Susd6Q8BGE4 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Susd6Q8BGE4 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Susd6Q8BGE4 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Susd6Q8BGE4 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Susd6Q8BGE4 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Susd6Q8BGE4 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Susd6Q8BGE4 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Susd6Q8BGE4 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Susd6Q8BGE4 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Susd6Q8BGE4 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Susd6Q8BGE4 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Susd6Q8BGE4 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Susd6Q8BGE4 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Susd6Q8BGE4 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Susd6Q8BGE4 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Susd6Q8BGE4 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Susd6Q8BGE4 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Susd6Q8BGE4 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Susd6Q8BGE4 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Susd6Q8BGE4 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Susd6Q8BGE4 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Susd6Q8BGE4 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Susd6Q8BGE4 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Susd6Q8BGE4 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Susd6Q8BGE4 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Susd6Q8BGE4 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Susd6Q8BGE4 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Susd6Q8BGE4 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Susd6Q8BGE4 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Susd6Q8BGE4 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Susd6Q8BGE4 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Susd6Q8BGE4 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Susd6Q8BGE4 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Susd6Q8BGE4 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Susd6Q8BGE4 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Susd6Q8BGE4 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Susd6Q8BGE4 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Susd6Q8BGE4 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Susd6Q8BGE4 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Susd6Q8BGE4 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Susd6Q8BGE4 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Susd6Q8BGE4 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Susd6Q8BGE4 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Susd6Q8BGE4 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Susd6Q8BGE4 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Susd6Q8BGE4 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Susd6Q8BGE4 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Susd6Q8BGE4 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Susd6Q8BGE4 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Susd6Q8BGE4 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Susd6Q8BGE4 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Susd6Q8BGE4 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Susd6Q8BGE4 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Susd6Q8BGE4 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Susd6Q8BGE4 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Susd6Q8BGE4 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Susd6Q8BGE4 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Susd6Q8BGE4 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Susd6Q8BGE4 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Susd6Q8BGE4 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Susd6Q8BGE4 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Susd6Q8BGE4 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Susd6Q8BGE4 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Susd6Q8BGE4 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Susd6Q8BGE4 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Susd6Q8BGE4 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Susd6Q8BGE4 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.6 ms