Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZU4

Smim19, Small integral membrane protein 19, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim19Q80ZU4 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC11.73□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.73□□□□□ -0.53
Smim19Q80ZU4 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.53
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