Protein–RNA interactions for Protein: Q7TST5

Lamp3, Lysosome-associated membrane glycoprotein 3, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp3Q7TST5 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lamp3Q7TST5 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lamp3Q7TST5 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lamp3Q7TST5 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lamp3Q7TST5 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lamp3Q7TST5 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lamp3Q7TST5 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lamp3Q7TST5 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lamp3Q7TST5 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lamp3Q7TST5 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lamp3Q7TST5 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lamp3Q7TST5 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Lamp3Q7TST5 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lamp3Q7TST5 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lamp3Q7TST5 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Lamp3Q7TST5 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Lamp3Q7TST5 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Lamp3Q7TST5 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Lamp3Q7TST5 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Lamp3Q7TST5 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Lamp3Q7TST5 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Lamp3Q7TST5 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Lamp3Q7TST5 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Lamp3Q7TST5 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Lamp3Q7TST5 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Lamp3Q7TST5 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Lamp3Q7TST5 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Lamp3Q7TST5 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Lamp3Q7TST5 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Lamp3Q7TST5 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Lamp3Q7TST5 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Lamp3Q7TST5 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Lamp3Q7TST5 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Lamp3Q7TST5 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Lamp3Q7TST5 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Lamp3Q7TST5 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Lamp3Q7TST5 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Lamp3Q7TST5 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Lamp3Q7TST5 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Lamp3Q7TST5 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Lamp3Q7TST5 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Lamp3Q7TST5 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Lamp3Q7TST5 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Lamp3Q7TST5 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Lamp3Q7TST5 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Lamp3Q7TST5 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Lamp3Q7TST5 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Lamp3Q7TST5 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Lamp3Q7TST5 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Lamp3Q7TST5 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Lamp3Q7TST5 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Lamp3Q7TST5 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Lamp3Q7TST5 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Lamp3Q7TST5 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Lamp3Q7TST5 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Lamp3Q7TST5 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Lamp3Q7TST5 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Lamp3Q7TST5 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Lamp3Q7TST5 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Lamp3Q7TST5 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Lamp3Q7TST5 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Lamp3Q7TST5 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Lamp3Q7TST5 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Lamp3Q7TST5 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Lamp3Q7TST5 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Lamp3Q7TST5 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Lamp3Q7TST5 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Lamp3Q7TST5 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Lamp3Q7TST5 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Lamp3Q7TST5 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Lamp3Q7TST5 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Lamp3Q7TST5 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Lamp3Q7TST5 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Lamp3Q7TST5 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Lamp3Q7TST5 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Lamp3Q7TST5 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Lamp3Q7TST5 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Lamp3Q7TST5 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Lamp3Q7TST5 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Lamp3Q7TST5 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Lamp3Q7TST5 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Lamp3Q7TST5 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lamp3Q7TST5 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lamp3Q7TST5 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lamp3Q7TST5 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lamp3Q7TST5 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lamp3Q7TST5 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lamp3Q7TST5 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lamp3Q7TST5 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lamp3Q7TST5 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lamp3Q7TST5 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lamp3Q7TST5 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lamp3Q7TST5 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lamp3Q7TST5 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lamp3Q7TST5 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Lamp3Q7TST5 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lamp3Q7TST5 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lamp3Q7TST5 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Lamp3Q7TST5 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Lamp3Q7TST5 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms