Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS55

Tnfsf18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf18Q7TS55 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Gcfc2-201ENSMUST00000043195 4192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Tnfsf18Q7TS55 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Dhtkd1-202ENSMUST00000095147 5480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Slc5a6-202ENSMUST00000114668 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Tnfsf18Q7TS55 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms