Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNK4

Zfp397, Zinc finger protein 397, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp397Q7TNK4 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Zfp397Q7TNK4 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zfp397Q7TNK4 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zfp397Q7TNK4 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zfp397Q7TNK4 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zfp397Q7TNK4 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zfp397Q7TNK4 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zfp397Q7TNK4 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zfp397Q7TNK4 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zfp397Q7TNK4 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zfp397Q7TNK4 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zfp397Q7TNK4 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zfp397Q7TNK4 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zfp397Q7TNK4 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zfp397Q7TNK4 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zfp397Q7TNK4 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zfp397Q7TNK4 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zfp397Q7TNK4 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zfp397Q7TNK4 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zfp397Q7TNK4 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Zfp397Q7TNK4 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zfp397Q7TNK4 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zfp397Q7TNK4 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zfp397Q7TNK4 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zfp397Q7TNK4 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zfp397Q7TNK4 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zfp397Q7TNK4 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Zfp397Q7TNK4 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfp397Q7TNK4 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfp397Q7TNK4 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfp397Q7TNK4 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfp397Q7TNK4 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfp397Q7TNK4 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfp397Q7TNK4 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfp397Q7TNK4 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfp397Q7TNK4 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfp397Q7TNK4 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfp397Q7TNK4 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfp397Q7TNK4 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfp397Q7TNK4 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfp397Q7TNK4 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfp397Q7TNK4 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfp397Q7TNK4 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfp397Q7TNK4 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfp397Q7TNK4 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfp397Q7TNK4 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfp397Q7TNK4 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfp397Q7TNK4 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfp397Q7TNK4 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfp397Q7TNK4 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfp397Q7TNK4 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfp397Q7TNK4 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfp397Q7TNK4 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfp397Q7TNK4 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfp397Q7TNK4 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfp397Q7TNK4 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfp397Q7TNK4 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Zfp397Q7TNK4 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp397Q7TNK4 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp397Q7TNK4 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp397Q7TNK4 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp397Q7TNK4 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp397Q7TNK4 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp397Q7TNK4 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp397Q7TNK4 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp397Q7TNK4 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp397Q7TNK4 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp397Q7TNK4 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp397Q7TNK4 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp397Q7TNK4 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp397Q7TNK4 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp397Q7TNK4 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp397Q7TNK4 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp397Q7TNK4 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp397Q7TNK4 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp397Q7TNK4 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp397Q7TNK4 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp397Q7TNK4 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp397Q7TNK4 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp397Q7TNK4 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Zfp397Q7TNK4 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zfp397Q7TNK4 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zfp397Q7TNK4 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zfp397Q7TNK4 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zfp397Q7TNK4 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zfp397Q7TNK4 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zfp397Q7TNK4 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zfp397Q7TNK4 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zfp397Q7TNK4 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zfp397Q7TNK4 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zfp397Q7TNK4 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Zfp397Q7TNK4 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zfp397Q7TNK4 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Zfp397Q7TNK4 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zfp397Q7TNK4 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zfp397Q7TNK4 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zfp397Q7TNK4 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zfp397Q7TNK4 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zfp397Q7TNK4 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Zfp397Q7TNK4 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms