Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN58

Tmc8, Transmembrane channel-like protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmc8Q7TN58 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmc8Q7TN58 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmc8Q7TN58 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tmc8Q7TN58 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tmc8Q7TN58 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tmc8Q7TN58 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Tmc8Q7TN58 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tmc8Q7TN58 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmc8Q7TN58 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmc8Q7TN58 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmc8Q7TN58 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmc8Q7TN58 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmc8Q7TN58 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmc8Q7TN58 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmc8Q7TN58 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmc8Q7TN58 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmc8Q7TN58 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmc8Q7TN58 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmc8Q7TN58 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmc8Q7TN58 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmc8Q7TN58 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmc8Q7TN58 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmc8Q7TN58 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmc8Q7TN58 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmc8Q7TN58 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmc8Q7TN58 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmc8Q7TN58 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tmc8Q7TN58 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmc8Q7TN58 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmc8Q7TN58 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmc8Q7TN58 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmc8Q7TN58 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmc8Q7TN58 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmc8Q7TN58 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmc8Q7TN58 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmc8Q7TN58 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmc8Q7TN58 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmc8Q7TN58 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmc8Q7TN58 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmc8Q7TN58 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmc8Q7TN58 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmc8Q7TN58 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmc8Q7TN58 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmc8Q7TN58 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmc8Q7TN58 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmc8Q7TN58 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmc8Q7TN58 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmc8Q7TN58 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmc8Q7TN58 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmc8Q7TN58 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmc8Q7TN58 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmc8Q7TN58 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmc8Q7TN58 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmc8Q7TN58 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmc8Q7TN58 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tmc8Q7TN58 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmc8Q7TN58 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmc8Q7TN58 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmc8Q7TN58 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmc8Q7TN58 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmc8Q7TN58 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmc8Q7TN58 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmc8Q7TN58 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmc8Q7TN58 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmc8Q7TN58 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmc8Q7TN58 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmc8Q7TN58 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmc8Q7TN58 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmc8Q7TN58 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmc8Q7TN58 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmc8Q7TN58 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmc8Q7TN58 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmc8Q7TN58 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmc8Q7TN58 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmc8Q7TN58 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmc8Q7TN58 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmc8Q7TN58 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmc8Q7TN58 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmc8Q7TN58 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmc8Q7TN58 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmc8Q7TN58 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tmc8Q7TN58 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmc8Q7TN58 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmc8Q7TN58 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmc8Q7TN58 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmc8Q7TN58 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmc8Q7TN58 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmc8Q7TN58 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmc8Q7TN58 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmc8Q7TN58 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmc8Q7TN58 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmc8Q7TN58 Mrpl40-202ENSMUST00000119273 778 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmc8Q7TN58 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmc8Q7TN58 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmc8Q7TN58 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmc8Q7TN58 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmc8Q7TN58 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmc8Q7TN58 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmc8Q7TN58 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tmc8Q7TN58 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms