Protein–RNA interactions for Protein: Q78WZ7

Twistnb, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TwistnbQ78WZ7 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TwistnbQ78WZ7 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TwistnbQ78WZ7 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TwistnbQ78WZ7 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TwistnbQ78WZ7 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TwistnbQ78WZ7 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TwistnbQ78WZ7 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TwistnbQ78WZ7 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TwistnbQ78WZ7 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TwistnbQ78WZ7 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TwistnbQ78WZ7 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TwistnbQ78WZ7 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TwistnbQ78WZ7 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TwistnbQ78WZ7 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TwistnbQ78WZ7 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
TwistnbQ78WZ7 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
TwistnbQ78WZ7 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TwistnbQ78WZ7 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TwistnbQ78WZ7 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TwistnbQ78WZ7 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TwistnbQ78WZ7 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TwistnbQ78WZ7 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TwistnbQ78WZ7 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
TwistnbQ78WZ7 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TwistnbQ78WZ7 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TwistnbQ78WZ7 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TwistnbQ78WZ7 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TwistnbQ78WZ7 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TwistnbQ78WZ7 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TwistnbQ78WZ7 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TwistnbQ78WZ7 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TwistnbQ78WZ7 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TwistnbQ78WZ7 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TwistnbQ78WZ7 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TwistnbQ78WZ7 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TwistnbQ78WZ7 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TwistnbQ78WZ7 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TwistnbQ78WZ7 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TwistnbQ78WZ7 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TwistnbQ78WZ7 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TwistnbQ78WZ7 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TwistnbQ78WZ7 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TwistnbQ78WZ7 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TwistnbQ78WZ7 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TwistnbQ78WZ7 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TwistnbQ78WZ7 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TwistnbQ78WZ7 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TwistnbQ78WZ7 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TwistnbQ78WZ7 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TwistnbQ78WZ7 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TwistnbQ78WZ7 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TwistnbQ78WZ7 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TwistnbQ78WZ7 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TwistnbQ78WZ7 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TwistnbQ78WZ7 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TwistnbQ78WZ7 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TwistnbQ78WZ7 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TwistnbQ78WZ7 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TwistnbQ78WZ7 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TwistnbQ78WZ7 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TwistnbQ78WZ7 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TwistnbQ78WZ7 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TwistnbQ78WZ7 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TwistnbQ78WZ7 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TwistnbQ78WZ7 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TwistnbQ78WZ7 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TwistnbQ78WZ7 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TwistnbQ78WZ7 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TwistnbQ78WZ7 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TwistnbQ78WZ7 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TwistnbQ78WZ7 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TwistnbQ78WZ7 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TwistnbQ78WZ7 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TwistnbQ78WZ7 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TwistnbQ78WZ7 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TwistnbQ78WZ7 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TwistnbQ78WZ7 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TwistnbQ78WZ7 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TwistnbQ78WZ7 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TwistnbQ78WZ7 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TwistnbQ78WZ7 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TwistnbQ78WZ7 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TwistnbQ78WZ7 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TwistnbQ78WZ7 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TwistnbQ78WZ7 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TwistnbQ78WZ7 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TwistnbQ78WZ7 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TwistnbQ78WZ7 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TwistnbQ78WZ7 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TwistnbQ78WZ7 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TwistnbQ78WZ7 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TwistnbQ78WZ7 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TwistnbQ78WZ7 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TwistnbQ78WZ7 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TwistnbQ78WZ7 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TwistnbQ78WZ7 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TwistnbQ78WZ7 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TwistnbQ78WZ7 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TwistnbQ78WZ7 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TwistnbQ78WZ7 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms