Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

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Length 685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp49Q6P9L4 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp49Q6P9L4 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp49Q6P9L4 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Usp49Q6P9L4 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Usp49Q6P9L4 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
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Usp49Q6P9L4 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Usp49Q6P9L4 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Usp49Q6P9L4 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Usp49Q6P9L4 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp49Q6P9L4 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp49Q6P9L4 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp49Q6P9L4 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp49Q6P9L4 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp49Q6P9L4 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Usp49Q6P9L4 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Usp49Q6P9L4 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Usp49Q6P9L4 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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