Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4T0

Atg2a, Autophagy-related protein 2 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 1,914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2aQ6P4T0 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atg2aQ6P4T0 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atg2aQ6P4T0 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atg2aQ6P4T0 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atg2aQ6P4T0 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atg2aQ6P4T0 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atg2aQ6P4T0 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atg2aQ6P4T0 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Atg2aQ6P4T0 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Atg2aQ6P4T0 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Atg2aQ6P4T0 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Atg2aQ6P4T0 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Atg2aQ6P4T0 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Atg2aQ6P4T0 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Atg2aQ6P4T0 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Atg2aQ6P4T0 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Atg2aQ6P4T0 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Atg2aQ6P4T0 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atg2aQ6P4T0 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atg2aQ6P4T0 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atg2aQ6P4T0 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Atg2aQ6P4T0 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atg2aQ6P4T0 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Atg2aQ6P4T0 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atg2aQ6P4T0 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Atg2aQ6P4T0 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atg2aQ6P4T0 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atg2aQ6P4T0 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg2aQ6P4T0 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg2aQ6P4T0 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg2aQ6P4T0 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Atg2aQ6P4T0 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg2aQ6P4T0 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Atg2aQ6P4T0 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg2aQ6P4T0 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg2aQ6P4T0 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg2aQ6P4T0 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg2aQ6P4T0 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg2aQ6P4T0 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg2aQ6P4T0 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg2aQ6P4T0 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg2aQ6P4T0 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg2aQ6P4T0 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg2aQ6P4T0 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg2aQ6P4T0 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Atg2aQ6P4T0 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg2aQ6P4T0 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Atg2aQ6P4T0 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg2aQ6P4T0 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Atg2aQ6P4T0 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Atg2aQ6P4T0 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg2aQ6P4T0 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Atg2aQ6P4T0 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Atg2aQ6P4T0 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Atg2aQ6P4T0 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Atg2aQ6P4T0 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atg2aQ6P4T0 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atg2aQ6P4T0 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atg2aQ6P4T0 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Atg2aQ6P4T0 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atg2aQ6P4T0 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atg2aQ6P4T0 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Atg2aQ6P4T0 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atg2aQ6P4T0 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Atg2aQ6P4T0 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atg2aQ6P4T0 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atg2aQ6P4T0 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Atg2aQ6P4T0 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atg2aQ6P4T0 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Atg2aQ6P4T0 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Atg2aQ6P4T0 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Atg2aQ6P4T0 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Atg2aQ6P4T0 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atg2aQ6P4T0 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atg2aQ6P4T0 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atg2aQ6P4T0 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Atg2aQ6P4T0 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Atg2aQ6P4T0 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Atg2aQ6P4T0 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atg2aQ6P4T0 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Atg2aQ6P4T0 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Atg2aQ6P4T0 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Atg2aQ6P4T0 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atg2aQ6P4T0 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Atg2aQ6P4T0 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atg2aQ6P4T0 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atg2aQ6P4T0 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Atg2aQ6P4T0 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Atg2aQ6P4T0 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atg2aQ6P4T0 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Atg2aQ6P4T0 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atg2aQ6P4T0 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Atg2aQ6P4T0 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atg2aQ6P4T0 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atg2aQ6P4T0 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atg2aQ6P4T0 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atg2aQ6P4T0 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atg2aQ6P4T0 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atg2aQ6P4T0 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atg2aQ6P4T0 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms