Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU7

Cep78, Centrosomal protein of 78 kDa, mousemouse

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Length 790 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep78Q6IRU7 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Cep78Q6IRU7 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cep78Q6IRU7 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cep78Q6IRU7 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cep78Q6IRU7 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cep78Q6IRU7 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cep78Q6IRU7 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cep78Q6IRU7 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cep78Q6IRU7 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cep78Q6IRU7 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cep78Q6IRU7 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cep78Q6IRU7 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cep78Q6IRU7 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cep78Q6IRU7 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cep78Q6IRU7 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Cep78Q6IRU7 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cep78Q6IRU7 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cep78Q6IRU7 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cep78Q6IRU7 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Cep78Q6IRU7 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cep78Q6IRU7 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cep78Q6IRU7 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Cep78Q6IRU7 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cep78Q6IRU7 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cep78Q6IRU7 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cep78Q6IRU7 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cep78Q6IRU7 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cep78Q6IRU7 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cep78Q6IRU7 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cep78Q6IRU7 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cep78Q6IRU7 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cep78Q6IRU7 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cep78Q6IRU7 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cep78Q6IRU7 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cep78Q6IRU7 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Cep78Q6IRU7 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Cep78Q6IRU7 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Cep78Q6IRU7 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cep78Q6IRU7 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cep78Q6IRU7 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cep78Q6IRU7 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cep78Q6IRU7 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cep78Q6IRU7 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cep78Q6IRU7 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cep78Q6IRU7 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cep78Q6IRU7 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cep78Q6IRU7 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cep78Q6IRU7 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cep78Q6IRU7 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cep78Q6IRU7 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cep78Q6IRU7 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cep78Q6IRU7 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cep78Q6IRU7 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cep78Q6IRU7 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cep78Q6IRU7 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cep78Q6IRU7 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Cep78Q6IRU7 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cep78Q6IRU7 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Cep78Q6IRU7 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cep78Q6IRU7 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cep78Q6IRU7 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cep78Q6IRU7 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cep78Q6IRU7 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cep78Q6IRU7 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cep78Q6IRU7 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Cep78Q6IRU7 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cep78Q6IRU7 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cep78Q6IRU7 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cep78Q6IRU7 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cep78Q6IRU7 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cep78Q6IRU7 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Cep78Q6IRU7 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Cep78Q6IRU7 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Cep78Q6IRU7 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cep78Q6IRU7 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cep78Q6IRU7 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cep78Q6IRU7 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cep78Q6IRU7 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cep78Q6IRU7 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cep78Q6IRU7 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cep78Q6IRU7 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cep78Q6IRU7 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cep78Q6IRU7 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cep78Q6IRU7 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cep78Q6IRU7 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cep78Q6IRU7 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cep78Q6IRU7 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Cep78Q6IRU7 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Cep78Q6IRU7 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cep78Q6IRU7 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cep78Q6IRU7 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cep78Q6IRU7 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Cep78Q6IRU7 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Cep78Q6IRU7 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cep78Q6IRU7 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cep78Q6IRU7 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Cep78Q6IRU7 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cep78Q6IRU7 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cep78Q6IRU7 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Cep78Q6IRU7 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
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