Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU5

Cltb, Clathrin light chain B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 229 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltbQ6IRU5 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CltbQ6IRU5 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CltbQ6IRU5 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CltbQ6IRU5 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CltbQ6IRU5 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CltbQ6IRU5 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CltbQ6IRU5 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CltbQ6IRU5 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CltbQ6IRU5 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CltbQ6IRU5 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CltbQ6IRU5 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CltbQ6IRU5 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CltbQ6IRU5 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CltbQ6IRU5 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CltbQ6IRU5 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CltbQ6IRU5 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CltbQ6IRU5 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CltbQ6IRU5 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CltbQ6IRU5 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
CltbQ6IRU5 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CltbQ6IRU5 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
CltbQ6IRU5 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CltbQ6IRU5 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CltbQ6IRU5 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
CltbQ6IRU5 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CltbQ6IRU5 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CltbQ6IRU5 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CltbQ6IRU5 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CltbQ6IRU5 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
CltbQ6IRU5 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
CltbQ6IRU5 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC13.71□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
CltbQ6IRU5 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms