Protein–RNA interactions for Protein: Q6IRU2

Tpm4, Tropomyosin alpha-4 chain, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm4Q6IRU2 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tpm4Q6IRU2 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Tpm4Q6IRU2 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tpm4Q6IRU2 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tpm4Q6IRU2 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tpm4Q6IRU2 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tpm4Q6IRU2 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tpm4Q6IRU2 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tpm4Q6IRU2 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tpm4Q6IRU2 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tpm4Q6IRU2 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tpm4Q6IRU2 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tpm4Q6IRU2 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tpm4Q6IRU2 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tpm4Q6IRU2 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tpm4Q6IRU2 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tpm4Q6IRU2 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tpm4Q6IRU2 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tpm4Q6IRU2 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tpm4Q6IRU2 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tpm4Q6IRU2 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Tpm4Q6IRU2 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tpm4Q6IRU2 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tpm4Q6IRU2 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tpm4Q6IRU2 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tpm4Q6IRU2 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tpm4Q6IRU2 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tpm4Q6IRU2 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tpm4Q6IRU2 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Tpm4Q6IRU2 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tpm4Q6IRU2 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tpm4Q6IRU2 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tpm4Q6IRU2 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tpm4Q6IRU2 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tpm4Q6IRU2 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tpm4Q6IRU2 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tpm4Q6IRU2 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tpm4Q6IRU2 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tpm4Q6IRU2 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tpm4Q6IRU2 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tpm4Q6IRU2 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tpm4Q6IRU2 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tpm4Q6IRU2 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tpm4Q6IRU2 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tpm4Q6IRU2 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tpm4Q6IRU2 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tpm4Q6IRU2 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tpm4Q6IRU2 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tpm4Q6IRU2 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tpm4Q6IRU2 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tpm4Q6IRU2 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tpm4Q6IRU2 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tpm4Q6IRU2 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tpm4Q6IRU2 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tpm4Q6IRU2 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tpm4Q6IRU2 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tpm4Q6IRU2 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Tpm4Q6IRU2 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tpm4Q6IRU2 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tpm4Q6IRU2 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tpm4Q6IRU2 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tpm4Q6IRU2 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tpm4Q6IRU2 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tpm4Q6IRU2 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tpm4Q6IRU2 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tpm4Q6IRU2 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tpm4Q6IRU2 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Tpm4Q6IRU2 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tpm4Q6IRU2 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Tpm4Q6IRU2 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tpm4Q6IRU2 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tpm4Q6IRU2 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tpm4Q6IRU2 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tpm4Q6IRU2 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tpm4Q6IRU2 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tpm4Q6IRU2 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tpm4Q6IRU2 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tpm4Q6IRU2 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tpm4Q6IRU2 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tpm4Q6IRU2 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tpm4Q6IRU2 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tpm4Q6IRU2 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Tpm4Q6IRU2 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tpm4Q6IRU2 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tpm4Q6IRU2 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Tpm4Q6IRU2 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tpm4Q6IRU2 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tpm4Q6IRU2 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tpm4Q6IRU2 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tpm4Q6IRU2 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tpm4Q6IRU2 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tpm4Q6IRU2 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tpm4Q6IRU2 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tpm4Q6IRU2 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tpm4Q6IRU2 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Tpm4Q6IRU2 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Tpm4Q6IRU2 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tpm4Q6IRU2 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tpm4Q6IRU2 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Tpm4Q6IRU2 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms