Protein–RNA interactions for Protein: Q6DID3

Scaf8, Protein SCAF8, mousemouse

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf8Q6DID3 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Scaf8Q6DID3 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Scaf8Q6DID3 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Scaf8Q6DID3 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Scaf8Q6DID3 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Scaf8Q6DID3 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Scaf8Q6DID3 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Scaf8Q6DID3 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Scaf8Q6DID3 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Scaf8Q6DID3 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Scaf8Q6DID3 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Scaf8Q6DID3 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Scaf8Q6DID3 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Scaf8Q6DID3 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Scaf8Q6DID3 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Scaf8Q6DID3 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Scaf8Q6DID3 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Scaf8Q6DID3 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Scaf8Q6DID3 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Scaf8Q6DID3 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Scaf8Q6DID3 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Scaf8Q6DID3 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Scaf8Q6DID3 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Scaf8Q6DID3 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Scaf8Q6DID3 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Scaf8Q6DID3 Rita1-201ENSMUST00000031599 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Scaf8Q6DID3 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Scaf8Q6DID3 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Scaf8Q6DID3 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Scaf8Q6DID3 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Scaf8Q6DID3 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Scaf8Q6DID3 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Scaf8Q6DID3 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Scaf8Q6DID3 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Scaf8Q6DID3 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Scaf8Q6DID3 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Scaf8Q6DID3 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Scaf8Q6DID3 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Scaf8Q6DID3 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Scaf8Q6DID3 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Scaf8Q6DID3 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Scaf8Q6DID3 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Scaf8Q6DID3 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Scaf8Q6DID3 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Scaf8Q6DID3 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Scaf8Q6DID3 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Scaf8Q6DID3 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Scaf8Q6DID3 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Scaf8Q6DID3 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Scaf8Q6DID3 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Scaf8Q6DID3 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Scaf8Q6DID3 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Scaf8Q6DID3 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Scaf8Q6DID3 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Scaf8Q6DID3 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Scaf8Q6DID3 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Scaf8Q6DID3 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Scaf8Q6DID3 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Scaf8Q6DID3 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Scaf8Q6DID3 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Scaf8Q6DID3 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Scaf8Q6DID3 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Scaf8Q6DID3 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Scaf8Q6DID3 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Scaf8Q6DID3 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Scaf8Q6DID3 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Scaf8Q6DID3 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Scaf8Q6DID3 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Scaf8Q6DID3 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Scaf8Q6DID3 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Scaf8Q6DID3 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Scaf8Q6DID3 AC238811.3-201ENSMUST00000225422 709 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Scaf8Q6DID3 Scgb3a2-201ENSMUST00000043803 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Scaf8Q6DID3 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Scaf8Q6DID3 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Scaf8Q6DID3 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Scaf8Q6DID3 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Scaf8Q6DID3 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Scaf8Q6DID3 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Scaf8Q6DID3 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Scaf8Q6DID3 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Scaf8Q6DID3 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Scaf8Q6DID3 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Scaf8Q6DID3 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Scaf8Q6DID3 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Scaf8Q6DID3 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Scaf8Q6DID3 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Scaf8Q6DID3 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Scaf8Q6DID3 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Scaf8Q6DID3 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Scaf8Q6DID3 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Scaf8Q6DID3 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Scaf8Q6DID3 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Scaf8Q6DID3 Rpl18-208ENSMUST00000211061 552 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Scaf8Q6DID3 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Scaf8Q6DID3 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Scaf8Q6DID3 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Scaf8Q6DID3 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Scaf8Q6DID3 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Scaf8Q6DID3 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms