Protein–RNA interactions for Protein: Q62445

Sp4, Transcription factor Sp4, mousemouse

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp4Q62445 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sp4Q62445 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sp4Q62445 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sp4Q62445 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sp4Q62445 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Sp4Q62445 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sp4Q62445 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sp4Q62445 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sp4Q62445 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sp4Q62445 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sp4Q62445 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sp4Q62445 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Sp4Q62445 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sp4Q62445 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sp4Q62445 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sp4Q62445 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sp4Q62445 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sp4Q62445 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sp4Q62445 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sp4Q62445 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sp4Q62445 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sp4Q62445 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Sp4Q62445 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Sp4Q62445 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sp4Q62445 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sp4Q62445 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sp4Q62445 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Sp4Q62445 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sp4Q62445 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sp4Q62445 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Sp4Q62445 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sp4Q62445 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sp4Q62445 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sp4Q62445 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sp4Q62445 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sp4Q62445 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sp4Q62445 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sp4Q62445 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sp4Q62445 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sp4Q62445 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sp4Q62445 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sp4Q62445 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sp4Q62445 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sp4Q62445 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Sp4Q62445 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sp4Q62445 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sp4Q62445 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sp4Q62445 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sp4Q62445 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sp4Q62445 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sp4Q62445 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sp4Q62445 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sp4Q62445 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sp4Q62445 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sp4Q62445 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sp4Q62445 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Sp4Q62445 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sp4Q62445 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sp4Q62445 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sp4Q62445 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sp4Q62445 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sp4Q62445 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Sp4Q62445 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sp4Q62445 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sp4Q62445 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sp4Q62445 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sp4Q62445 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sp4Q62445 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sp4Q62445 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Sp4Q62445 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sp4Q62445 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sp4Q62445 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Sp4Q62445 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sp4Q62445 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sp4Q62445 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sp4Q62445 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Sp4Q62445 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Sp4Q62445 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sp4Q62445 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Sp4Q62445 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sp4Q62445 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sp4Q62445 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sp4Q62445 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sp4Q62445 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sp4Q62445 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sp4Q62445 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sp4Q62445 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Sp4Q62445 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sp4Q62445 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Sp4Q62445 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sp4Q62445 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sp4Q62445 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sp4Q62445 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sp4Q62445 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sp4Q62445 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sp4Q62445 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sp4Q62445 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sp4Q62445 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sp4Q62445 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Sp4Q62445 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms