Protein–RNA interactions for Protein: Q62420

Sh3gl2, Endophilin-A1, mousemouse

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Length 352 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3gl2Q62420 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3gl2Q62420 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3gl2Q62420 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3gl2Q62420 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3gl2Q62420 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3gl2Q62420 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3gl2Q62420 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3gl2Q62420 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3gl2Q62420 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3gl2Q62420 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3gl2Q62420 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3gl2Q62420 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3gl2Q62420 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3gl2Q62420 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3gl2Q62420 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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Sh3gl2Q62420 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3gl2Q62420 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3gl2Q62420 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3gl2Q62420 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3gl2Q62420 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3gl2Q62420 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3gl2Q62420 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3gl2Q62420 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3gl2Q62420 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Sh3gl2Q62420 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh3gl2Q62420 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh3gl2Q62420 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh3gl2Q62420 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh3gl2Q62420 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh3gl2Q62420 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh3gl2Q62420 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh3gl2Q62420 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Sh3gl2Q62420 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh3gl2Q62420 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh3gl2Q62420 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh3gl2Q62420 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Sh3gl2Q62420 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh3gl2Q62420 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh3gl2Q62420 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh3gl2Q62420 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh3gl2Q62420 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Sh3gl2Q62420 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Sh3gl2Q62420 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3gl2Q62420 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3gl2Q62420 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Sh3gl2Q62420 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3gl2Q62420 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Sh3gl2Q62420 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Sh3gl2Q62420 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
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Sh3gl2Q62420 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3gl2Q62420 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3gl2Q62420 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3gl2Q62420 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3gl2Q62420 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3gl2Q62420 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3gl2Q62420 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3gl2Q62420 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3gl2Q62420 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3gl2Q62420 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3gl2Q62420 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3gl2Q62420 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Sh3gl2Q62420 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh3gl2Q62420 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh3gl2Q62420 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh3gl2Q62420 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh3gl2Q62420 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh3gl2Q62420 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh3gl2Q62420 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh3gl2Q62420 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh3gl2Q62420 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh3gl2Q62420 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh3gl2Q62420 H13-202ENSMUST00000089059 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh3gl2Q62420 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh3gl2Q62420 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh3gl2Q62420 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh3gl2Q62420 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh3gl2Q62420 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Sh3gl2Q62420 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms