Protein–RNA interactions for Protein: Q62141

Sin3b, Paired amphipathic helix protein Sin3b, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3bQ62141 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sin3bQ62141 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sin3bQ62141 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sin3bQ62141 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sin3bQ62141 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sin3bQ62141 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sin3bQ62141 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Sin3bQ62141 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sin3bQ62141 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sin3bQ62141 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sin3bQ62141 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sin3bQ62141 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sin3bQ62141 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sin3bQ62141 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sin3bQ62141 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sin3bQ62141 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sin3bQ62141 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sin3bQ62141 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sin3bQ62141 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sin3bQ62141 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sin3bQ62141 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Sin3bQ62141 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sin3bQ62141 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sin3bQ62141 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sin3bQ62141 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Sin3bQ62141 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sin3bQ62141 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sin3bQ62141 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sin3bQ62141 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sin3bQ62141 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sin3bQ62141 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sin3bQ62141 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sin3bQ62141 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sin3bQ62141 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sin3bQ62141 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sin3bQ62141 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sin3bQ62141 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sin3bQ62141 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sin3bQ62141 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sin3bQ62141 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sin3bQ62141 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sin3bQ62141 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sin3bQ62141 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sin3bQ62141 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sin3bQ62141 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sin3bQ62141 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sin3bQ62141 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sin3bQ62141 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Sin3bQ62141 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Sin3bQ62141 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sin3bQ62141 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sin3bQ62141 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sin3bQ62141 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sin3bQ62141 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sin3bQ62141 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sin3bQ62141 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sin3bQ62141 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sin3bQ62141 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Sin3bQ62141 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sin3bQ62141 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sin3bQ62141 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sin3bQ62141 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sin3bQ62141 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sin3bQ62141 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sin3bQ62141 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sin3bQ62141 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sin3bQ62141 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sin3bQ62141 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sin3bQ62141 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Sin3bQ62141 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sin3bQ62141 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sin3bQ62141 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sin3bQ62141 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sin3bQ62141 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sin3bQ62141 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sin3bQ62141 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sin3bQ62141 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sin3bQ62141 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sin3bQ62141 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sin3bQ62141 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sin3bQ62141 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sin3bQ62141 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Sin3bQ62141 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sin3bQ62141 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sin3bQ62141 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sin3bQ62141 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sin3bQ62141 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sin3bQ62141 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sin3bQ62141 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sin3bQ62141 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sin3bQ62141 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sin3bQ62141 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sin3bQ62141 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sin3bQ62141 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sin3bQ62141 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sin3bQ62141 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sin3bQ62141 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sin3bQ62141 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sin3bQ62141 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Sin3bQ62141 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms