Protein–RNA interactions for Protein: Q61045

Sim1, Single-minded homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sim1Q61045 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sim1Q61045 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms