Protein–RNA interactions for Protein: Q60764

Mkrn3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, mousemouse

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Length 544 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Mkrn3Q60764 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mkrn3Q60764 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mkrn3Q60764 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mkrn3Q60764 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Mkrn3Q60764 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mkrn3Q60764 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mkrn3Q60764 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mkrn3Q60764 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Mkrn3Q60764 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Mkrn3Q60764 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mkrn3Q60764 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
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Mkrn3Q60764 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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Mkrn3Q60764 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mkrn3Q60764 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mkrn3Q60764 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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Mkrn3Q60764 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mkrn3Q60764 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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Mkrn3Q60764 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
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