Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVD6

Vmn1r195, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r195Q5SVD6 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vmn1r195Q5SVD6 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vmn1r195Q5SVD6 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vmn1r195Q5SVD6 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vmn1r195Q5SVD6 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vmn1r195Q5SVD6 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vmn1r195Q5SVD6 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vmn1r195Q5SVD6 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vmn1r195Q5SVD6 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vmn1r195Q5SVD6 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vmn1r195Q5SVD6 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vmn1r195Q5SVD6 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vmn1r195Q5SVD6 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vmn1r195Q5SVD6 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vmn1r195Q5SVD6 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vmn1r195Q5SVD6 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vmn1r195Q5SVD6 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vmn1r195Q5SVD6 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vmn1r195Q5SVD6 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vmn1r195Q5SVD6 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vmn1r195Q5SVD6 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vmn1r195Q5SVD6 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Vmn1r195Q5SVD6 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Vmn1r195Q5SVD6 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Vmn1r195Q5SVD6 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Vmn1r195Q5SVD6 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Vmn1r195Q5SVD6 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Vmn1r195Q5SVD6 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Vmn1r195Q5SVD6 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Vmn1r195Q5SVD6 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Vmn1r195Q5SVD6 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Vmn1r195Q5SVD6 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Vmn1r195Q5SVD6 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Vmn1r195Q5SVD6 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Vmn1r195Q5SVD6 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Vmn1r195Q5SVD6 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Vmn1r195Q5SVD6 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Vmn1r195Q5SVD6 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Vmn1r195Q5SVD6 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Vmn1r195Q5SVD6 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Vmn1r195Q5SVD6 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Vmn1r195Q5SVD6 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Vmn1r195Q5SVD6 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Vmn1r195Q5SVD6 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Vmn1r195Q5SVD6 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Vmn1r195Q5SVD6 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Vmn1r195Q5SVD6 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Vmn1r195Q5SVD6 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Vmn1r195Q5SVD6 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Vmn1r195Q5SVD6 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Vmn1r195Q5SVD6 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Vmn1r195Q5SVD6 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Vmn1r195Q5SVD6 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Vmn1r195Q5SVD6 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Vmn1r195Q5SVD6 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Vmn1r195Q5SVD6 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Vmn1r195Q5SVD6 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Vmn1r195Q5SVD6 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Vmn1r195Q5SVD6 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Vmn1r195Q5SVD6 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Vmn1r195Q5SVD6 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Vmn1r195Q5SVD6 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Vmn1r195Q5SVD6 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Vmn1r195Q5SVD6 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Vmn1r195Q5SVD6 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Vmn1r195Q5SVD6 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Vmn1r195Q5SVD6 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Vmn1r195Q5SVD6 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Vmn1r195Q5SVD6 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Vmn1r195Q5SVD6 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Vmn1r195Q5SVD6 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Vmn1r195Q5SVD6 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Vmn1r195Q5SVD6 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Vmn1r195Q5SVD6 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Vmn1r195Q5SVD6 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Vmn1r195Q5SVD6 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Vmn1r195Q5SVD6 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Vmn1r195Q5SVD6 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Vmn1r195Q5SVD6 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Vmn1r195Q5SVD6 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Vmn1r195Q5SVD6 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Vmn1r195Q5SVD6 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Vmn1r195Q5SVD6 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Vmn1r195Q5SVD6 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Vmn1r195Q5SVD6 Fn1-211ENSMUST00000187938 7965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Vmn1r195Q5SVD6 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Vmn1r195Q5SVD6 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Vmn1r195Q5SVD6 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Vmn1r195Q5SVD6 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Vmn1r195Q5SVD6 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Vmn1r195Q5SVD6 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Vmn1r195Q5SVD6 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Vmn1r195Q5SVD6 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Vmn1r195Q5SVD6 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Vmn1r195Q5SVD6 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Vmn1r195Q5SVD6 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Vmn1r195Q5SVD6 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Vmn1r195Q5SVD6 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Vmn1r195Q5SVD6 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Vmn1r195Q5SVD6 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms