Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSZ7

Znrf3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, mousemouse

Predictions only

Length 913 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znrf3Q5SSZ7 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znrf3Q5SSZ7 Mir7085-201ENSMUST00000184353 66 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Znrf3Q5SSZ7 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Znrf3Q5SSZ7 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Znrf3Q5SSZ7 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Znrf3Q5SSZ7 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znrf3Q5SSZ7 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znrf3Q5SSZ7 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znrf3Q5SSZ7 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znrf3Q5SSZ7 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znrf3Q5SSZ7 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znrf3Q5SSZ7 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znrf3Q5SSZ7 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znrf3Q5SSZ7 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znrf3Q5SSZ7 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znrf3Q5SSZ7 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Znrf3Q5SSZ7 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znrf3Q5SSZ7 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znrf3Q5SSZ7 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Znrf3Q5SSZ7 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Znrf3Q5SSZ7 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Znrf3Q5SSZ7 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znrf3Q5SSZ7 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znrf3Q5SSZ7 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znrf3Q5SSZ7 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znrf3Q5SSZ7 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znrf3Q5SSZ7 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Znrf3Q5SSZ7 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znrf3Q5SSZ7 Gm31728-201ENSMUST00000192164 435 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znrf3Q5SSZ7 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Znrf3Q5SSZ7 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Znrf3Q5SSZ7 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znrf3Q5SSZ7 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znrf3Q5SSZ7 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znrf3Q5SSZ7 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znrf3Q5SSZ7 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znrf3Q5SSZ7 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Znrf3Q5SSZ7 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znrf3Q5SSZ7 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znrf3Q5SSZ7 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znrf3Q5SSZ7 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znrf3Q5SSZ7 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znrf3Q5SSZ7 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znrf3Q5SSZ7 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znrf3Q5SSZ7 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Znrf3Q5SSZ7 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znrf3Q5SSZ7 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znrf3Q5SSZ7 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znrf3Q5SSZ7 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znrf3Q5SSZ7 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znrf3Q5SSZ7 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znrf3Q5SSZ7 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znrf3Q5SSZ7 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znrf3Q5SSZ7 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znrf3Q5SSZ7 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znrf3Q5SSZ7 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znrf3Q5SSZ7 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znrf3Q5SSZ7 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Znrf3Q5SSZ7 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znrf3Q5SSZ7 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znrf3Q5SSZ7 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Znrf3Q5SSZ7 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znrf3Q5SSZ7 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znrf3Q5SSZ7 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znrf3Q5SSZ7 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znrf3Q5SSZ7 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znrf3Q5SSZ7 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znrf3Q5SSZ7 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Znrf3Q5SSZ7 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znrf3Q5SSZ7 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znrf3Q5SSZ7 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znrf3Q5SSZ7 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znrf3Q5SSZ7 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znrf3Q5SSZ7 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znrf3Q5SSZ7 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znrf3Q5SSZ7 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znrf3Q5SSZ7 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znrf3Q5SSZ7 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znrf3Q5SSZ7 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znrf3Q5SSZ7 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Znrf3Q5SSZ7 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Znrf3Q5SSZ7 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Znrf3Q5SSZ7 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Znrf3Q5SSZ7 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Znrf3Q5SSZ7 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Znrf3Q5SSZ7 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Znrf3Q5SSZ7 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Znrf3Q5SSZ7 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Znrf3Q5SSZ7 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Znrf3Q5SSZ7 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Znrf3Q5SSZ7 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Znrf3Q5SSZ7 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Znrf3Q5SSZ7 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Znrf3Q5SSZ7 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Znrf3Q5SSZ7 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Znrf3Q5SSZ7 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Znrf3Q5SSZ7 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Znrf3Q5SSZ7 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Znrf3Q5SSZ7 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Znrf3Q5SSZ7 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms