Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0G7

Garnl3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Garnl3Q3V0G7 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Garnl3Q3V0G7 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Garnl3Q3V0G7 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Garnl3Q3V0G7 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Garnl3Q3V0G7 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Garnl3Q3V0G7 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Garnl3Q3V0G7 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Garnl3Q3V0G7 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Garnl3Q3V0G7 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Garnl3Q3V0G7 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Garnl3Q3V0G7 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Garnl3Q3V0G7 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Garnl3Q3V0G7 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Garnl3Q3V0G7 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Garnl3Q3V0G7 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Garnl3Q3V0G7 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Garnl3Q3V0G7 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Garnl3Q3V0G7 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Garnl3Q3V0G7 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Garnl3Q3V0G7 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Garnl3Q3V0G7 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Garnl3Q3V0G7 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Garnl3Q3V0G7 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Garnl3Q3V0G7 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Garnl3Q3V0G7 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Garnl3Q3V0G7 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Garnl3Q3V0G7 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Garnl3Q3V0G7 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Garnl3Q3V0G7 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Garnl3Q3V0G7 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Garnl3Q3V0G7 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Garnl3Q3V0G7 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Garnl3Q3V0G7 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Garnl3Q3V0G7 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Garnl3Q3V0G7 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Garnl3Q3V0G7 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Garnl3Q3V0G7 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Garnl3Q3V0G7 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Garnl3Q3V0G7 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Garnl3Q3V0G7 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Garnl3Q3V0G7 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Garnl3Q3V0G7 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Garnl3Q3V0G7 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Garnl3Q3V0G7 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Garnl3Q3V0G7 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Garnl3Q3V0G7 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Garnl3Q3V0G7 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Garnl3Q3V0G7 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Garnl3Q3V0G7 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Garnl3Q3V0G7 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Garnl3Q3V0G7 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Garnl3Q3V0G7 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Garnl3Q3V0G7 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Garnl3Q3V0G7 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Garnl3Q3V0G7 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Garnl3Q3V0G7 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Garnl3Q3V0G7 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Garnl3Q3V0G7 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Garnl3Q3V0G7 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Garnl3Q3V0G7 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Garnl3Q3V0G7 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Garnl3Q3V0G7 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Garnl3Q3V0G7 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Garnl3Q3V0G7 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Garnl3Q3V0G7 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Garnl3Q3V0G7 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Garnl3Q3V0G7 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Garnl3Q3V0G7 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Garnl3Q3V0G7 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Garnl3Q3V0G7 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Garnl3Q3V0G7 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Garnl3Q3V0G7 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Garnl3Q3V0G7 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Garnl3Q3V0G7 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Garnl3Q3V0G7 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Garnl3Q3V0G7 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Garnl3Q3V0G7 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Garnl3Q3V0G7 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Garnl3Q3V0G7 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Garnl3Q3V0G7 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Garnl3Q3V0G7 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Garnl3Q3V0G7 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Garnl3Q3V0G7 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Garnl3Q3V0G7 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Garnl3Q3V0G7 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Garnl3Q3V0G7 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Garnl3Q3V0G7 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Garnl3Q3V0G7 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Garnl3Q3V0G7 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Garnl3Q3V0G7 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Garnl3Q3V0G7 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Garnl3Q3V0G7 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Garnl3Q3V0G7 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Garnl3Q3V0G7 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Garnl3Q3V0G7 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Garnl3Q3V0G7 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Garnl3Q3V0G7 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Garnl3Q3V0G7 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Garnl3Q3V0G7 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Garnl3Q3V0G7 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms