Protein–RNA interactions for Protein: Q3V063

4933416C03Rik, MCG64776, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933416C03RikQ3V063 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4933416C03RikQ3V063 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4933416C03RikQ3V063 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
4933416C03RikQ3V063 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
4933416C03RikQ3V063 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
4933416C03RikQ3V063 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
4933416C03RikQ3V063 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
4933416C03RikQ3V063 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
4933416C03RikQ3V063 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
4933416C03RikQ3V063 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
4933416C03RikQ3V063 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
4933416C03RikQ3V063 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
4933416C03RikQ3V063 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
4933416C03RikQ3V063 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
4933416C03RikQ3V063 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
4933416C03RikQ3V063 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
4933416C03RikQ3V063 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
4933416C03RikQ3V063 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
4933416C03RikQ3V063 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
4933416C03RikQ3V063 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
4933416C03RikQ3V063 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
4933416C03RikQ3V063 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
4933416C03RikQ3V063 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
4933416C03RikQ3V063 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
4933416C03RikQ3V063 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
4933416C03RikQ3V063 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
4933416C03RikQ3V063 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
4933416C03RikQ3V063 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
4933416C03RikQ3V063 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
4933416C03RikQ3V063 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
4933416C03RikQ3V063 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
4933416C03RikQ3V063 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
4933416C03RikQ3V063 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
4933416C03RikQ3V063 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
4933416C03RikQ3V063 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
4933416C03RikQ3V063 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
4933416C03RikQ3V063 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
4933416C03RikQ3V063 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
4933416C03RikQ3V063 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
4933416C03RikQ3V063 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
4933416C03RikQ3V063 Gm43868-201ENSMUST00000205187 2114 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
4933416C03RikQ3V063 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4933416C03RikQ3V063 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4933416C03RikQ3V063 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4933416C03RikQ3V063 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4933416C03RikQ3V063 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
4933416C03RikQ3V063 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4933416C03RikQ3V063 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4933416C03RikQ3V063 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4933416C03RikQ3V063 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
4933416C03RikQ3V063 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
4933416C03RikQ3V063 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4933416C03RikQ3V063 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4933416C03RikQ3V063 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4933416C03RikQ3V063 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
4933416C03RikQ3V063 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
4933416C03RikQ3V063 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4933416C03RikQ3V063 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4933416C03RikQ3V063 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4933416C03RikQ3V063 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4933416C03RikQ3V063 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4933416C03RikQ3V063 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4933416C03RikQ3V063 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4933416C03RikQ3V063 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
4933416C03RikQ3V063 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4933416C03RikQ3V063 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4933416C03RikQ3V063 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4933416C03RikQ3V063 Spock1-202ENSMUST00000185502 4614 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
4933416C03RikQ3V063 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4933416C03RikQ3V063 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4933416C03RikQ3V063 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4933416C03RikQ3V063 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4933416C03RikQ3V063 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4933416C03RikQ3V063 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
4933416C03RikQ3V063 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4933416C03RikQ3V063 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4933416C03RikQ3V063 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4933416C03RikQ3V063 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4933416C03RikQ3V063 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4933416C03RikQ3V063 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
4933416C03RikQ3V063 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
4933416C03RikQ3V063 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
4933416C03RikQ3V063 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4933416C03RikQ3V063 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4933416C03RikQ3V063 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4933416C03RikQ3V063 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4933416C03RikQ3V063 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4933416C03RikQ3V063 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4933416C03RikQ3V063 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
4933416C03RikQ3V063 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
4933416C03RikQ3V063 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4933416C03RikQ3V063 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4933416C03RikQ3V063 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4933416C03RikQ3V063 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
4933416C03RikQ3V063 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4933416C03RikQ3V063 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4933416C03RikQ3V063 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4933416C03RikQ3V063 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4933416C03RikQ3V063 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
4933416C03RikQ3V063 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 167 ms