Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ01

Rnpc3, RNA-binding protein 40, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnpc3Q3UZ01 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rnpc3Q3UZ01 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rnpc3Q3UZ01 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rnpc3Q3UZ01 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rnpc3Q3UZ01 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rnpc3Q3UZ01 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Rnpc3Q3UZ01 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnpc3Q3UZ01 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnpc3Q3UZ01 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnpc3Q3UZ01 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnpc3Q3UZ01 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnpc3Q3UZ01 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnpc3Q3UZ01 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnpc3Q3UZ01 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnpc3Q3UZ01 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnpc3Q3UZ01 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnpc3Q3UZ01 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnpc3Q3UZ01 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnpc3Q3UZ01 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnpc3Q3UZ01 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnpc3Q3UZ01 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnpc3Q3UZ01 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnpc3Q3UZ01 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnpc3Q3UZ01 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnpc3Q3UZ01 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnpc3Q3UZ01 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnpc3Q3UZ01 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnpc3Q3UZ01 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnpc3Q3UZ01 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnpc3Q3UZ01 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnpc3Q3UZ01 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnpc3Q3UZ01 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnpc3Q3UZ01 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnpc3Q3UZ01 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnpc3Q3UZ01 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnpc3Q3UZ01 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnpc3Q3UZ01 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnpc3Q3UZ01 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnpc3Q3UZ01 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnpc3Q3UZ01 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Rnpc3Q3UZ01 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnpc3Q3UZ01 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnpc3Q3UZ01 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnpc3Q3UZ01 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnpc3Q3UZ01 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnpc3Q3UZ01 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnpc3Q3UZ01 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnpc3Q3UZ01 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnpc3Q3UZ01 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnpc3Q3UZ01 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnpc3Q3UZ01 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnpc3Q3UZ01 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnpc3Q3UZ01 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnpc3Q3UZ01 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnpc3Q3UZ01 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnpc3Q3UZ01 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnpc3Q3UZ01 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnpc3Q3UZ01 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnpc3Q3UZ01 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnpc3Q3UZ01 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnpc3Q3UZ01 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnpc3Q3UZ01 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnpc3Q3UZ01 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnpc3Q3UZ01 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnpc3Q3UZ01 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnpc3Q3UZ01 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnpc3Q3UZ01 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnpc3Q3UZ01 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Rnpc3Q3UZ01 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnpc3Q3UZ01 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnpc3Q3UZ01 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnpc3Q3UZ01 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnpc3Q3UZ01 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnpc3Q3UZ01 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnpc3Q3UZ01 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnpc3Q3UZ01 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnpc3Q3UZ01 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnpc3Q3UZ01 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnpc3Q3UZ01 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnpc3Q3UZ01 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnpc3Q3UZ01 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnpc3Q3UZ01 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnpc3Q3UZ01 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnpc3Q3UZ01 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnpc3Q3UZ01 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnpc3Q3UZ01 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnpc3Q3UZ01 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnpc3Q3UZ01 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnpc3Q3UZ01 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnpc3Q3UZ01 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnpc3Q3UZ01 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnpc3Q3UZ01 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnpc3Q3UZ01 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Rnpc3Q3UZ01 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnpc3Q3UZ01 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnpc3Q3UZ01 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnpc3Q3UZ01 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnpc3Q3UZ01 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnpc3Q3UZ01 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Rnpc3Q3UZ01 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms