Protein–RNA interactions for Protein: Q3UXB0

Mbd3l2, Methyl-CpG-binding domain protein 3-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3l2Q3UXB0 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mbd3l2Q3UXB0 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mbd3l2Q3UXB0 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Mbd3l2Q3UXB0 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mbd3l2Q3UXB0 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mbd3l2Q3UXB0 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mbd3l2Q3UXB0 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mbd3l2Q3UXB0 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mbd3l2Q3UXB0 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mbd3l2Q3UXB0 Sde2-201ENSMUST00000038091 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mbd3l2Q3UXB0 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mbd3l2Q3UXB0 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mbd3l2Q3UXB0 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mbd3l2Q3UXB0 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mbd3l2Q3UXB0 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mbd3l2Q3UXB0 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mbd3l2Q3UXB0 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mbd3l2Q3UXB0 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Mbd3l2Q3UXB0 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Mbd3l2Q3UXB0 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Mbd3l2Q3UXB0 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Mbd3l2Q3UXB0 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Mbd3l2Q3UXB0 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Mbd3l2Q3UXB0 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Mbd3l2Q3UXB0 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Mbd3l2Q3UXB0 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Mbd3l2Q3UXB0 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Mbd3l2Q3UXB0 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Mbd3l2Q3UXB0 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Mbd3l2Q3UXB0 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Mbd3l2Q3UXB0 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Mbd3l2Q3UXB0 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Mbd3l2Q3UXB0 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Mbd3l2Q3UXB0 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Mbd3l2Q3UXB0 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Mbd3l2Q3UXB0 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Mbd3l2Q3UXB0 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Mbd3l2Q3UXB0 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Mbd3l2Q3UXB0 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Mbd3l2Q3UXB0 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Mbd3l2Q3UXB0 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Mbd3l2Q3UXB0 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Mbd3l2Q3UXB0 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Mbd3l2Q3UXB0 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Mbd3l2Q3UXB0 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Mbd3l2Q3UXB0 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Mbd3l2Q3UXB0 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Mbd3l2Q3UXB0 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Mbd3l2Q3UXB0 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Mbd3l2Q3UXB0 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Mbd3l2Q3UXB0 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Mbd3l2Q3UXB0 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Mbd3l2Q3UXB0 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Mbd3l2Q3UXB0 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Mbd3l2Q3UXB0 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Mbd3l2Q3UXB0 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Mbd3l2Q3UXB0 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Mbd3l2Q3UXB0 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Mbd3l2Q3UXB0 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Mbd3l2Q3UXB0 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Mbd3l2Q3UXB0 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Mbd3l2Q3UXB0 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Mbd3l2Q3UXB0 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Mbd3l2Q3UXB0 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
Mbd3l2Q3UXB0 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Mbd3l2Q3UXB0 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Mbd3l2Q3UXB0 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Mbd3l2Q3UXB0 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Mbd3l2Q3UXB0 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Mbd3l2Q3UXB0 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Mbd3l2Q3UXB0 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Mbd3l2Q3UXB0 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Mbd3l2Q3UXB0 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Mbd3l2Q3UXB0 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Mbd3l2Q3UXB0 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Mbd3l2Q3UXB0 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Mbd3l2Q3UXB0 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Mbd3l2Q3UXB0 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Mbd3l2Q3UXB0 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Mbd3l2Q3UXB0 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Mbd3l2Q3UXB0 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Mbd3l2Q3UXB0 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Mbd3l2Q3UXB0 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Mbd3l2Q3UXB0 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Mbd3l2Q3UXB0 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Mbd3l2Q3UXB0 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Mbd3l2Q3UXB0 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Mbd3l2Q3UXB0 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Mbd3l2Q3UXB0 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Mbd3l2Q3UXB0 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Mbd3l2Q3UXB0 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Mbd3l2Q3UXB0 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Mbd3l2Q3UXB0 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Mbd3l2Q3UXB0 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Mbd3l2Q3UXB0 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Mbd3l2Q3UXB0 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Mbd3l2Q3UXB0 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Mbd3l2Q3UXB0 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Mbd3l2Q3UXB0 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Mbd3l2Q3UXB0 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48 ms