Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
E130208F15RikQ3UPV3 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms