Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMU9

Hdgfl2, Hepatoma-derived growth factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl2Q3UMU9 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Hdgfl2Q3UMU9 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Hdgfl2Q3UMU9 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Hdgfl2Q3UMU9 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hdgfl2Q3UMU9 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hdgfl2Q3UMU9 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hdgfl2Q3UMU9 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hdgfl2Q3UMU9 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hdgfl2Q3UMU9 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hdgfl2Q3UMU9 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Hdgfl2Q3UMU9 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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