Protein–RNA interactions for Protein: Q3UD01

Atxn7l3b, Ataxin-7-like protein 3B, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn7l3bQ3UD01 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Atxn7l3bQ3UD01 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atxn7l3bQ3UD01 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Atxn7l3bQ3UD01 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atxn7l3bQ3UD01 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Atxn7l3bQ3UD01 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atxn7l3bQ3UD01 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atxn7l3bQ3UD01 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Atxn7l3bQ3UD01 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atxn7l3bQ3UD01 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atxn7l3bQ3UD01 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atxn7l3bQ3UD01 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Atxn7l3bQ3UD01 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Atxn7l3bQ3UD01 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atxn7l3bQ3UD01 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Atxn7l3bQ3UD01 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atxn7l3bQ3UD01 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atxn7l3bQ3UD01 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Atxn7l3bQ3UD01 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atxn7l3bQ3UD01 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atxn7l3bQ3UD01 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atxn7l3bQ3UD01 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atxn7l3bQ3UD01 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atxn7l3bQ3UD01 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atxn7l3bQ3UD01 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Atxn7l3bQ3UD01 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Atxn7l3bQ3UD01 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atxn7l3bQ3UD01 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Atxn7l3bQ3UD01 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atxn7l3bQ3UD01 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Atxn7l3bQ3UD01 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Atxn7l3bQ3UD01 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Atxn7l3bQ3UD01 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Atxn7l3bQ3UD01 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atxn7l3bQ3UD01 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atxn7l3bQ3UD01 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Atxn7l3bQ3UD01 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atxn7l3bQ3UD01 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Atxn7l3bQ3UD01 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atxn7l3bQ3UD01 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atxn7l3bQ3UD01 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Atxn7l3bQ3UD01 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atxn7l3bQ3UD01 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atxn7l3bQ3UD01 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atxn7l3bQ3UD01 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atxn7l3bQ3UD01 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Atxn7l3bQ3UD01 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atxn7l3bQ3UD01 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atxn7l3bQ3UD01 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Atxn7l3bQ3UD01 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Atxn7l3bQ3UD01 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Atxn7l3bQ3UD01 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Atxn7l3bQ3UD01 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atxn7l3bQ3UD01 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Atxn7l3bQ3UD01 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Atxn7l3bQ3UD01 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Atxn7l3bQ3UD01 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Atxn7l3bQ3UD01 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atxn7l3bQ3UD01 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atxn7l3bQ3UD01 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atxn7l3bQ3UD01 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atxn7l3bQ3UD01 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Atxn7l3bQ3UD01 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Atxn7l3bQ3UD01 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Atxn7l3bQ3UD01 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Atxn7l3bQ3UD01 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atxn7l3bQ3UD01 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Atxn7l3bQ3UD01 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Atxn7l3bQ3UD01 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Atxn7l3bQ3UD01 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Atxn7l3bQ3UD01 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Atxn7l3bQ3UD01 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Atxn7l3bQ3UD01 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Atxn7l3bQ3UD01 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Atxn7l3bQ3UD01 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Atxn7l3bQ3UD01 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Atxn7l3bQ3UD01 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atxn7l3bQ3UD01 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atxn7l3bQ3UD01 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Atxn7l3bQ3UD01 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Atxn7l3bQ3UD01 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Atxn7l3bQ3UD01 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Atxn7l3bQ3UD01 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atxn7l3bQ3UD01 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Atxn7l3bQ3UD01 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Atxn7l3bQ3UD01 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atxn7l3bQ3UD01 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Atxn7l3bQ3UD01 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atxn7l3bQ3UD01 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atxn7l3bQ3UD01 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Atxn7l3bQ3UD01 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atxn7l3bQ3UD01 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atxn7l3bQ3UD01 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Atxn7l3bQ3UD01 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atxn7l3bQ3UD01 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atxn7l3bQ3UD01 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Atxn7l3bQ3UD01 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atxn7l3bQ3UD01 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atxn7l3bQ3UD01 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Atxn7l3bQ3UD01 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms