Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6U5

Gtpbp6, Putative GTP-binding protein 6, mousemouse

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Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp6Q3U6U5 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
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Gtpbp6Q3U6U5 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Gm15787-203ENSMUST00000130892 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Nrxn1-214ENSMUST00000173222 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
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Gtpbp6Q3U6U5 mt-Nd2-201ENSMUST00000082396 1038 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
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Gtpbp6Q3U6U5 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
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Gtpbp6Q3U6U5 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
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Gtpbp6Q3U6U5 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
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Gtpbp6Q3U6U5 Gm6578-201ENSMUST00000080891 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
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Gtpbp6Q3U6U5 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
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Gtpbp6Q3U6U5 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
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Gtpbp6Q3U6U5 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
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Gtpbp6Q3U6U5 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
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Gtpbp6Q3U6U5 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
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Gtpbp6Q3U6U5 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
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Gtpbp6Q3U6U5 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtpbp6Q3U6U5 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gtpbp6Q3U6U5 Gm19253-201ENSMUST00000204279 307 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms