Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccndbp1Q3TVC7 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccndbp1Q3TVC7 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccndbp1Q3TVC7 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccndbp1Q3TVC7 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccndbp1Q3TVC7 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccndbp1Q3TVC7 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccndbp1Q3TVC7 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccndbp1Q3TVC7 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccndbp1Q3TVC7 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccndbp1Q3TVC7 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccndbp1Q3TVC7 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ccndbp1Q3TVC7 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccndbp1Q3TVC7 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms