Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTJ4

Uncharacterized protein C8orf48 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TTJ4 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Q3TTJ4 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q3TTJ4 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q3TTJ4 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q3TTJ4 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q3TTJ4 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q3TTJ4 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q3TTJ4 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q3TTJ4 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q3TTJ4 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q3TTJ4 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q3TTJ4 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q3TTJ4 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q3TTJ4 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q3TTJ4 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q3TTJ4 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q3TTJ4 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q3TTJ4 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q3TTJ4 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q3TTJ4 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q3TTJ4 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q3TTJ4 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q3TTJ4 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q3TTJ4 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q3TTJ4 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q3TTJ4 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q3TTJ4 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q3TTJ4 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q3TTJ4 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q3TTJ4 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q3TTJ4 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q3TTJ4 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q3TTJ4 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q3TTJ4 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q3TTJ4 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q3TTJ4 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q3TTJ4 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q3TTJ4 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q3TTJ4 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q3TTJ4 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q3TTJ4 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q3TTJ4 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q3TTJ4 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q3TTJ4 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q3TTJ4 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q3TTJ4 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q3TTJ4 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q3TTJ4 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q3TTJ4 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q3TTJ4 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q3TTJ4 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Q3TTJ4 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Q3TTJ4 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Q3TTJ4 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q3TTJ4 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q3TTJ4 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Q3TTJ4 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC16■□□□□ 0.15
Q3TTJ4 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q3TTJ4 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q3TTJ4 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q3TTJ4 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Q3TTJ4 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Q3TTJ4 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q3TTJ4 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Q3TTJ4 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q3TTJ4 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q3TTJ4 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q3TTJ4 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q3TTJ4 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Q3TTJ4 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q3TTJ4 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q3TTJ4 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q3TTJ4 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q3TTJ4 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q3TTJ4 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q3TTJ4 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q3TTJ4 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q3TTJ4 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q3TTJ4 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q3TTJ4 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Q3TTJ4 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q3TTJ4 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q3TTJ4 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q3TTJ4 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q3TTJ4 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q3TTJ4 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q3TTJ4 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q3TTJ4 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Q3TTJ4 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q3TTJ4 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q3TTJ4 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q3TTJ4 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q3TTJ4 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q3TTJ4 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q3TTJ4 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q3TTJ4 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Q3TTJ4 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q3TTJ4 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q3TTJ4 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Q3TTJ4 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms