Protein–RNA interactions for Protein: Q3TNH5

Fam172a, Protein FAM172A, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam172aQ3TNH5 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fam172aQ3TNH5 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fam172aQ3TNH5 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fam172aQ3TNH5 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fam172aQ3TNH5 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fam172aQ3TNH5 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Fam172aQ3TNH5 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fam172aQ3TNH5 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fam172aQ3TNH5 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fam172aQ3TNH5 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fam172aQ3TNH5 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Fam172aQ3TNH5 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam172aQ3TNH5 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam172aQ3TNH5 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam172aQ3TNH5 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam172aQ3TNH5 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam172aQ3TNH5 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam172aQ3TNH5 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam172aQ3TNH5 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam172aQ3TNH5 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam172aQ3TNH5 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam172aQ3TNH5 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam172aQ3TNH5 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam172aQ3TNH5 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam172aQ3TNH5 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam172aQ3TNH5 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam172aQ3TNH5 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam172aQ3TNH5 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam172aQ3TNH5 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam172aQ3TNH5 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam172aQ3TNH5 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam172aQ3TNH5 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam172aQ3TNH5 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam172aQ3TNH5 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam172aQ3TNH5 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam172aQ3TNH5 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam172aQ3TNH5 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam172aQ3TNH5 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam172aQ3TNH5 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam172aQ3TNH5 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam172aQ3TNH5 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam172aQ3TNH5 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam172aQ3TNH5 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Fam172aQ3TNH5 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam172aQ3TNH5 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam172aQ3TNH5 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam172aQ3TNH5 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam172aQ3TNH5 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam172aQ3TNH5 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam172aQ3TNH5 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam172aQ3TNH5 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam172aQ3TNH5 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam172aQ3TNH5 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam172aQ3TNH5 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam172aQ3TNH5 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam172aQ3TNH5 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam172aQ3TNH5 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam172aQ3TNH5 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam172aQ3TNH5 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam172aQ3TNH5 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam172aQ3TNH5 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam172aQ3TNH5 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam172aQ3TNH5 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam172aQ3TNH5 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam172aQ3TNH5 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam172aQ3TNH5 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam172aQ3TNH5 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam172aQ3TNH5 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam172aQ3TNH5 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam172aQ3TNH5 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam172aQ3TNH5 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam172aQ3TNH5 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Fam172aQ3TNH5 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam172aQ3TNH5 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam172aQ3TNH5 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam172aQ3TNH5 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam172aQ3TNH5 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam172aQ3TNH5 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam172aQ3TNH5 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam172aQ3TNH5 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam172aQ3TNH5 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam172aQ3TNH5 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam172aQ3TNH5 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam172aQ3TNH5 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam172aQ3TNH5 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam172aQ3TNH5 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam172aQ3TNH5 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam172aQ3TNH5 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam172aQ3TNH5 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam172aQ3TNH5 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam172aQ3TNH5 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam172aQ3TNH5 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam172aQ3TNH5 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam172aQ3TNH5 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam172aQ3TNH5 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam172aQ3TNH5 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam172aQ3TNH5 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam172aQ3TNH5 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam172aQ3TNH5 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Fam172aQ3TNH5 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms