Protein–RNA interactions for Protein: Q3TJD7

Pdlim7, PDZ and LIM domain protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdlim7Q3TJD7 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pdlim7Q3TJD7 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdlim7Q3TJD7 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdlim7Q3TJD7 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdlim7Q3TJD7 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdlim7Q3TJD7 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdlim7Q3TJD7 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdlim7Q3TJD7 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdlim7Q3TJD7 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdlim7Q3TJD7 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdlim7Q3TJD7 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdlim7Q3TJD7 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdlim7Q3TJD7 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdlim7Q3TJD7 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdlim7Q3TJD7 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdlim7Q3TJD7 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdlim7Q3TJD7 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdlim7Q3TJD7 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdlim7Q3TJD7 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdlim7Q3TJD7 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdlim7Q3TJD7 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdlim7Q3TJD7 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdlim7Q3TJD7 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdlim7Q3TJD7 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdlim7Q3TJD7 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdlim7Q3TJD7 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdlim7Q3TJD7 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdlim7Q3TJD7 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdlim7Q3TJD7 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdlim7Q3TJD7 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pdlim7Q3TJD7 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdlim7Q3TJD7 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdlim7Q3TJD7 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdlim7Q3TJD7 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdlim7Q3TJD7 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdlim7Q3TJD7 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdlim7Q3TJD7 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdlim7Q3TJD7 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdlim7Q3TJD7 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdlim7Q3TJD7 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdlim7Q3TJD7 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdlim7Q3TJD7 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdlim7Q3TJD7 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdlim7Q3TJD7 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdlim7Q3TJD7 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdlim7Q3TJD7 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdlim7Q3TJD7 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdlim7Q3TJD7 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdlim7Q3TJD7 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdlim7Q3TJD7 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdlim7Q3TJD7 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdlim7Q3TJD7 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdlim7Q3TJD7 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdlim7Q3TJD7 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pdlim7Q3TJD7 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Pdlim7Q3TJD7 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pdlim7Q3TJD7 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pdlim7Q3TJD7 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pdlim7Q3TJD7 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Pdlim7Q3TJD7 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pdlim7Q3TJD7 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pdlim7Q3TJD7 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdlim7Q3TJD7 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdlim7Q3TJD7 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdlim7Q3TJD7 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdlim7Q3TJD7 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdlim7Q3TJD7 Tex22-203ENSMUST00000146107 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdlim7Q3TJD7 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdlim7Q3TJD7 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdlim7Q3TJD7 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdlim7Q3TJD7 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdlim7Q3TJD7 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdlim7Q3TJD7 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdlim7Q3TJD7 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdlim7Q3TJD7 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdlim7Q3TJD7 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdlim7Q3TJD7 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdlim7Q3TJD7 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdlim7Q3TJD7 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdlim7Q3TJD7 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdlim7Q3TJD7 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdlim7Q3TJD7 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdlim7Q3TJD7 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdlim7Q3TJD7 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdlim7Q3TJD7 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pdlim7Q3TJD7 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdlim7Q3TJD7 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdlim7Q3TJD7 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdlim7Q3TJD7 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdlim7Q3TJD7 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdlim7Q3TJD7 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdlim7Q3TJD7 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdlim7Q3TJD7 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdlim7Q3TJD7 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdlim7Q3TJD7 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdlim7Q3TJD7 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdlim7Q3TJD7 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdlim7Q3TJD7 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdlim7Q3TJD7 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Pdlim7Q3TJD7 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms