Protein–RNA interactions for Protein: Q3THW5

H2afv, Histone H2A.V, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afvQ3THW5 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2afvQ3THW5 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2afvQ3THW5 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2afvQ3THW5 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2afvQ3THW5 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2afvQ3THW5 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2afvQ3THW5 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2afvQ3THW5 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2afvQ3THW5 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
H2afvQ3THW5 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2afvQ3THW5 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
H2afvQ3THW5 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
H2afvQ3THW5 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2afvQ3THW5 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2afvQ3THW5 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2afvQ3THW5 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
H2afvQ3THW5 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2afvQ3THW5 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
H2afvQ3THW5 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2afvQ3THW5 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2afvQ3THW5 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2afvQ3THW5 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2afvQ3THW5 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2afvQ3THW5 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2afvQ3THW5 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2afvQ3THW5 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2afvQ3THW5 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2afvQ3THW5 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2afvQ3THW5 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2afvQ3THW5 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2afvQ3THW5 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2afvQ3THW5 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2afvQ3THW5 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2afvQ3THW5 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2afvQ3THW5 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2afvQ3THW5 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2afvQ3THW5 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2afvQ3THW5 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2afvQ3THW5 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
H2afvQ3THW5 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2afvQ3THW5 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2afvQ3THW5 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2afvQ3THW5 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2afvQ3THW5 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2afvQ3THW5 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2afvQ3THW5 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2afvQ3THW5 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2afvQ3THW5 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2afvQ3THW5 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2afvQ3THW5 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
H2afvQ3THW5 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
H2afvQ3THW5 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2afvQ3THW5 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2afvQ3THW5 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2afvQ3THW5 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
H2afvQ3THW5 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2afvQ3THW5 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2afvQ3THW5 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2afvQ3THW5 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2afvQ3THW5 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2afvQ3THW5 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2afvQ3THW5 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2afvQ3THW5 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2afvQ3THW5 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2afvQ3THW5 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2afvQ3THW5 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2afvQ3THW5 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2afvQ3THW5 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2afvQ3THW5 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2afvQ3THW5 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2afvQ3THW5 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2afvQ3THW5 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2afvQ3THW5 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2afvQ3THW5 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2afvQ3THW5 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2afvQ3THW5 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2afvQ3THW5 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2afvQ3THW5 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2afvQ3THW5 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
H2afvQ3THW5 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2afvQ3THW5 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2afvQ3THW5 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2afvQ3THW5 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2afvQ3THW5 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2afvQ3THW5 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2afvQ3THW5 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2afvQ3THW5 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2afvQ3THW5 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
H2afvQ3THW5 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2afvQ3THW5 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2afvQ3THW5 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2afvQ3THW5 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2afvQ3THW5 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2afvQ3THW5 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2afvQ3THW5 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2afvQ3THW5 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2afvQ3THW5 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2afvQ3THW5 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2afvQ3THW5 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2afvQ3THW5 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms