Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPR5

Hdgfl1, Hepatoma-derived growth factor-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl1Q2VPR5 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hdgfl1Q2VPR5 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hdgfl1Q2VPR5 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Hdgfl1Q2VPR5 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hdgfl1Q2VPR5 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hdgfl1Q2VPR5 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hdgfl1Q2VPR5 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hdgfl1Q2VPR5 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hdgfl1Q2VPR5 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hdgfl1Q2VPR5 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hdgfl1Q2VPR5 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hdgfl1Q2VPR5 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hdgfl1Q2VPR5 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hdgfl1Q2VPR5 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hdgfl1Q2VPR5 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hdgfl1Q2VPR5 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hdgfl1Q2VPR5 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hdgfl1Q2VPR5 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hdgfl1Q2VPR5 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hdgfl1Q2VPR5 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hdgfl1Q2VPR5 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hdgfl1Q2VPR5 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hdgfl1Q2VPR5 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hdgfl1Q2VPR5 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hdgfl1Q2VPR5 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hdgfl1Q2VPR5 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hdgfl1Q2VPR5 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hdgfl1Q2VPR5 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hdgfl1Q2VPR5 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hdgfl1Q2VPR5 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hdgfl1Q2VPR5 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hdgfl1Q2VPR5 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hdgfl1Q2VPR5 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hdgfl1Q2VPR5 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hdgfl1Q2VPR5 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hdgfl1Q2VPR5 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hdgfl1Q2VPR5 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hdgfl1Q2VPR5 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hdgfl1Q2VPR5 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hdgfl1Q2VPR5 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hdgfl1Q2VPR5 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hdgfl1Q2VPR5 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hdgfl1Q2VPR5 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hdgfl1Q2VPR5 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hdgfl1Q2VPR5 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hdgfl1Q2VPR5 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hdgfl1Q2VPR5 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms