Protein–RNA interactions for Protein: Q2MH31

Smrp1, Spermatid-specific manchette-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smrp1Q2MH31 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smrp1Q2MH31 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Smrp1Q2MH31 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Smrp1Q2MH31 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smrp1Q2MH31 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smrp1Q2MH31 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smrp1Q2MH31 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smrp1Q2MH31 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smrp1Q2MH31 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smrp1Q2MH31 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Smrp1Q2MH31 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smrp1Q2MH31 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smrp1Q2MH31 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smrp1Q2MH31 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smrp1Q2MH31 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smrp1Q2MH31 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smrp1Q2MH31 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Smrp1Q2MH31 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smrp1Q2MH31 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smrp1Q2MH31 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smrp1Q2MH31 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smrp1Q2MH31 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smrp1Q2MH31 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Smrp1Q2MH31 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smrp1Q2MH31 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smrp1Q2MH31 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smrp1Q2MH31 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smrp1Q2MH31 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smrp1Q2MH31 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smrp1Q2MH31 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smrp1Q2MH31 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smrp1Q2MH31 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smrp1Q2MH31 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smrp1Q2MH31 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smrp1Q2MH31 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smrp1Q2MH31 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smrp1Q2MH31 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smrp1Q2MH31 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smrp1Q2MH31 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smrp1Q2MH31 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smrp1Q2MH31 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smrp1Q2MH31 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smrp1Q2MH31 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Smrp1Q2MH31 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smrp1Q2MH31 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Smrp1Q2MH31 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smrp1Q2MH31 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smrp1Q2MH31 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smrp1Q2MH31 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Smrp1Q2MH31 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smrp1Q2MH31 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Smrp1Q2MH31 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smrp1Q2MH31 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smrp1Q2MH31 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Smrp1Q2MH31 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smrp1Q2MH31 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smrp1Q2MH31 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smrp1Q2MH31 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smrp1Q2MH31 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smrp1Q2MH31 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Smrp1Q2MH31 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smrp1Q2MH31 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smrp1Q2MH31 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smrp1Q2MH31 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smrp1Q2MH31 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smrp1Q2MH31 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smrp1Q2MH31 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smrp1Q2MH31 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smrp1Q2MH31 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Smrp1Q2MH31 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smrp1Q2MH31 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smrp1Q2MH31 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smrp1Q2MH31 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smrp1Q2MH31 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smrp1Q2MH31 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smrp1Q2MH31 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smrp1Q2MH31 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smrp1Q2MH31 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smrp1Q2MH31 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smrp1Q2MH31 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smrp1Q2MH31 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smrp1Q2MH31 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smrp1Q2MH31 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smrp1Q2MH31 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smrp1Q2MH31 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smrp1Q2MH31 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smrp1Q2MH31 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smrp1Q2MH31 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smrp1Q2MH31 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smrp1Q2MH31 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Smrp1Q2MH31 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smrp1Q2MH31 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smrp1Q2MH31 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smrp1Q2MH31 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smrp1Q2MH31 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smrp1Q2MH31 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Smrp1Q2MH31 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smrp1Q2MH31 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smrp1Q2MH31 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Smrp1Q2MH31 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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