Protein–RNA interactions for Protein: Q1W617

Shroom4, Protein Shroom4, mousemouse

Predictions only

Length 1,475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Shroom4Q1W617 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
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Shroom4Q1W617 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
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Shroom4Q1W617 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Shroom4Q1W617 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Shroom4Q1W617 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
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Shroom4Q1W617 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Shroom4Q1W617 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Shroom4Q1W617 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Shroom4Q1W617 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Shroom4Q1W617 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Shroom4Q1W617 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Shroom4Q1W617 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Shroom4Q1W617 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Shroom4Q1W617 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Shroom4Q1W617 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Shroom4Q1W617 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Shroom4Q1W617 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Shroom4Q1W617 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Shroom4Q1W617 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Shroom4Q1W617 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Shroom4Q1W617 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Shroom4Q1W617 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Shroom4Q1W617 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Shroom4Q1W617 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Shroom4Q1W617 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
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