Protein–RNA interactions for Protein: Q14B62

ptchd1, Patched domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 888 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ptchd1Q14B62 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
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ptchd1Q14B62 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ptchd1Q14B62 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
ptchd1Q14B62 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ptchd1Q14B62 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ptchd1Q14B62 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
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ptchd1Q14B62 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ptchd1Q14B62 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ptchd1Q14B62 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
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ptchd1Q14B62 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ptchd1Q14B62 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ptchd1Q14B62 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
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ptchd1Q14B62 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
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ptchd1Q14B62 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
ptchd1Q14B62 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
ptchd1Q14B62 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
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ptchd1Q14B62 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
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ptchd1Q14B62 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
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ptchd1Q14B62 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
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ptchd1Q14B62 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
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ptchd1Q14B62 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ptchd1Q14B62 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ptchd1Q14B62 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ptchd1Q14B62 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ptchd1Q14B62 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
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ptchd1Q14B62 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ptchd1Q14B62 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
ptchd1Q14B62 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ptchd1Q14B62 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ptchd1Q14B62 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ptchd1Q14B62 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ptchd1Q14B62 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ptchd1Q14B62 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ptchd1Q14B62 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ptchd1Q14B62 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ptchd1Q14B62 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ptchd1Q14B62 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ptchd1Q14B62 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ptchd1Q14B62 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ptchd1Q14B62 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ptchd1Q14B62 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ptchd1Q14B62 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
ptchd1Q14B62 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
ptchd1Q14B62 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
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