Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE82

Cpne7, Copine-7, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne7Q0VE82 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpne7Q0VE82 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpne7Q0VE82 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpne7Q0VE82 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpne7Q0VE82 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpne7Q0VE82 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpne7Q0VE82 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpne7Q0VE82 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpne7Q0VE82 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpne7Q0VE82 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpne7Q0VE82 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpne7Q0VE82 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpne7Q0VE82 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpne7Q0VE82 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpne7Q0VE82 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpne7Q0VE82 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpne7Q0VE82 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpne7Q0VE82 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cpne7Q0VE82 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpne7Q0VE82 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpne7Q0VE82 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpne7Q0VE82 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpne7Q0VE82 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpne7Q0VE82 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpne7Q0VE82 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpne7Q0VE82 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpne7Q0VE82 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpne7Q0VE82 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpne7Q0VE82 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpne7Q0VE82 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpne7Q0VE82 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpne7Q0VE82 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpne7Q0VE82 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpne7Q0VE82 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpne7Q0VE82 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpne7Q0VE82 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpne7Q0VE82 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpne7Q0VE82 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpne7Q0VE82 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cpne7Q0VE82 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cpne7Q0VE82 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cpne7Q0VE82 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cpne7Q0VE82 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cpne7Q0VE82 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cpne7Q0VE82 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cpne7Q0VE82 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cpne7Q0VE82 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpne7Q0VE82 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpne7Q0VE82 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpne7Q0VE82 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpne7Q0VE82 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpne7Q0VE82 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpne7Q0VE82 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpne7Q0VE82 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpne7Q0VE82 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpne7Q0VE82 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpne7Q0VE82 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpne7Q0VE82 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpne7Q0VE82 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpne7Q0VE82 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpne7Q0VE82 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpne7Q0VE82 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpne7Q0VE82 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpne7Q0VE82 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpne7Q0VE82 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpne7Q0VE82 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpne7Q0VE82 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpne7Q0VE82 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpne7Q0VE82 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpne7Q0VE82 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpne7Q0VE82 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpne7Q0VE82 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpne7Q0VE82 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpne7Q0VE82 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpne7Q0VE82 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpne7Q0VE82 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpne7Q0VE82 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpne7Q0VE82 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpne7Q0VE82 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpne7Q0VE82 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpne7Q0VE82 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpne7Q0VE82 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cpne7Q0VE82 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpne7Q0VE82 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpne7Q0VE82 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpne7Q0VE82 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpne7Q0VE82 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpne7Q0VE82 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpne7Q0VE82 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpne7Q0VE82 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpne7Q0VE82 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpne7Q0VE82 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpne7Q0VE82 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpne7Q0VE82 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpne7Q0VE82 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpne7Q0VE82 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpne7Q0VE82 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpne7Q0VE82 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpne7Q0VE82 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cpne7Q0VE82 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms