Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ubxn2bQ0KL01 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ubxn2bQ0KL01 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ubxn2bQ0KL01 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ubxn2bQ0KL01 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ubxn2bQ0KL01 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ubxn2bQ0KL01 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ubxn2bQ0KL01 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ubxn2bQ0KL01 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ubxn2bQ0KL01 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ubxn2bQ0KL01 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ubxn2bQ0KL01 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ubxn2bQ0KL01 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ubxn2bQ0KL01 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ubxn2bQ0KL01 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ubxn2bQ0KL01 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ubxn2bQ0KL01 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ubxn2bQ0KL01 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ubxn2bQ0KL01 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ubxn2bQ0KL01 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ubxn2bQ0KL01 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ubxn2bQ0KL01 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ubxn2bQ0KL01 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ubxn2bQ0KL01 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ubxn2bQ0KL01 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ubxn2bQ0KL01 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ubxn2bQ0KL01 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ubxn2bQ0KL01 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ubxn2bQ0KL01 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ubxn2bQ0KL01 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ubxn2bQ0KL01 Cd27-203ENSMUST00000112282 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ubxn2bQ0KL01 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ubxn2bQ0KL01 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ubxn2bQ0KL01 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ubxn2bQ0KL01 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ubxn2bQ0KL01 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ubxn2bQ0KL01 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ubxn2bQ0KL01 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ubxn2bQ0KL01 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ubxn2bQ0KL01 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ubxn2bQ0KL01 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ubxn2bQ0KL01 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ubxn2bQ0KL01 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ubxn2bQ0KL01 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ubxn2bQ0KL01 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ubxn2bQ0KL01 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ubxn2bQ0KL01 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ubxn2bQ0KL01 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ubxn2bQ0KL01 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ubxn2bQ0KL01 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ubxn2bQ0KL01 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ubxn2bQ0KL01 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ubxn2bQ0KL01 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ubxn2bQ0KL01 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ubxn2bQ0KL01 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Ubxn2bQ0KL01 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ubxn2bQ0KL01 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Ubxn2bQ0KL01 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ubxn2bQ0KL01 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ubxn2bQ0KL01 Atp6v0e-201ENSMUST00000015719 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ubxn2bQ0KL01 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Ubxn2bQ0KL01 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ubxn2bQ0KL01 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Ubxn2bQ0KL01 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Ubxn2bQ0KL01 Gm29787-201ENSMUST00000222129 849 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Ubxn2bQ0KL01 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ubxn2bQ0KL01 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ubxn2bQ0KL01 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ubxn2bQ0KL01 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ubxn2bQ0KL01 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ubxn2bQ0KL01 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ubxn2bQ0KL01 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ubxn2bQ0KL01 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ubxn2bQ0KL01 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ubxn2bQ0KL01 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ubxn2bQ0KL01 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Ubxn2bQ0KL01 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ubxn2bQ0KL01 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ubxn2bQ0KL01 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ubxn2bQ0KL01 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ubxn2bQ0KL01 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ubxn2bQ0KL01 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ubxn2bQ0KL01 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ubxn2bQ0KL01 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ubxn2bQ0KL01 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ubxn2bQ0KL01 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Ubxn2bQ0KL01 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Ubxn2bQ0KL01 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Ubxn2bQ0KL01 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ubxn2bQ0KL01 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ubxn2bQ0KL01 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ubxn2bQ0KL01 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ubxn2bQ0KL01 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ubxn2bQ0KL01 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ubxn2bQ0KL01 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ubxn2bQ0KL01 Klk6-203ENSMUST00000107968 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ubxn2bQ0KL01 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ubxn2bQ0KL01 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ubxn2bQ0KL01 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ubxn2bQ0KL01 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms