Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ttc21bQ0HA38 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Ttc21bQ0HA38 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Ttc21bQ0HA38 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ttc21bQ0HA38 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ttc21bQ0HA38 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ttc21bQ0HA38 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ttc21bQ0HA38 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ttc21bQ0HA38 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ttc21bQ0HA38 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ttc21bQ0HA38 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ttc21bQ0HA38 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ttc21bQ0HA38 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ttc21bQ0HA38 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ttc21bQ0HA38 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ttc21bQ0HA38 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ttc21bQ0HA38 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Ttc21bQ0HA38 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Ttc21bQ0HA38 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ttc21bQ0HA38 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ttc21bQ0HA38 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Ttc21bQ0HA38 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Ttc21bQ0HA38 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Ttc21bQ0HA38 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ttc21bQ0HA38 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ttc21bQ0HA38 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ttc21bQ0HA38 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ttc21bQ0HA38 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ttc21bQ0HA38 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ttc21bQ0HA38 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ttc21bQ0HA38 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ttc21bQ0HA38 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ttc21bQ0HA38 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ttc21bQ0HA38 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ttc21bQ0HA38 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ttc21bQ0HA38 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ttc21bQ0HA38 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ttc21bQ0HA38 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ttc21bQ0HA38 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ttc21bQ0HA38 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Ttc21bQ0HA38 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Ttc21bQ0HA38 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Ttc21bQ0HA38 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC20.77■□□□□ 0.91
Ttc21bQ0HA38 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Ttc21bQ0HA38 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Ttc21bQ0HA38 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Ttc21bQ0HA38 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Ttc21bQ0HA38 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Ttc21bQ0HA38 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ttc21bQ0HA38 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ttc21bQ0HA38 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ttc21bQ0HA38 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ttc21bQ0HA38 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ttc21bQ0HA38 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ttc21bQ0HA38 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ttc21bQ0HA38 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ttc21bQ0HA38 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ttc21bQ0HA38 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ttc21bQ0HA38 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ttc21bQ0HA38 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ttc21bQ0HA38 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ttc21bQ0HA38 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ttc21bQ0HA38 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ttc21bQ0HA38 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ttc21bQ0HA38 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ttc21bQ0HA38 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Ttc21bQ0HA38 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ttc21bQ0HA38 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ttc21bQ0HA38 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Ttc21bQ0HA38 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ttc21bQ0HA38 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ttc21bQ0HA38 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ttc21bQ0HA38 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ttc21bQ0HA38 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ttc21bQ0HA38 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ttc21bQ0HA38 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ttc21bQ0HA38 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ttc21bQ0HA38 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ttc21bQ0HA38 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ttc21bQ0HA38 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ttc21bQ0HA38 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ttc21bQ0HA38 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ttc21bQ0HA38 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ttc21bQ0HA38 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ttc21bQ0HA38 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ttc21bQ0HA38 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ttc21bQ0HA38 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ttc21bQ0HA38 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ttc21bQ0HA38 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ttc21bQ0HA38 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ttc21bQ0HA38 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ttc21bQ0HA38 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Ttc21bQ0HA38 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ttc21bQ0HA38 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ttc21bQ0HA38 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Ttc21bQ0HA38 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ttc21bQ0HA38 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ttc21bQ0HA38 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ttc21bQ0HA38 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ttc21bQ0HA38 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms