Protein–RNA interactions for Protein: Q07802

Ebf1, Transcription factor COE1, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ebf1Q07802 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ebf1Q07802 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ebf1Q07802 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ebf1Q07802 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ebf1Q07802 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ebf1Q07802 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ebf1Q07802 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ebf1Q07802 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ebf1Q07802 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ebf1Q07802 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ebf1Q07802 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ebf1Q07802 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ebf1Q07802 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ebf1Q07802 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ebf1Q07802 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ebf1Q07802 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ebf1Q07802 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ebf1Q07802 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ebf1Q07802 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ebf1Q07802 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ebf1Q07802 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ebf1Q07802 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ebf1Q07802 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ebf1Q07802 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ebf1Q07802 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ebf1Q07802 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ebf1Q07802 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ebf1Q07802 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ebf1Q07802 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ebf1Q07802 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ebf1Q07802 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ebf1Q07802 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ebf1Q07802 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ebf1Q07802 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ebf1Q07802 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ebf1Q07802 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ebf1Q07802 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ebf1Q07802 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ebf1Q07802 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ebf1Q07802 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ebf1Q07802 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ebf1Q07802 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ebf1Q07802 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ebf1Q07802 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ebf1Q07802 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ebf1Q07802 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ebf1Q07802 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ebf1Q07802 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ebf1Q07802 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ebf1Q07802 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ebf1Q07802 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ebf1Q07802 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ebf1Q07802 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ebf1Q07802 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ebf1Q07802 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ebf1Q07802 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ebf1Q07802 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ebf1Q07802 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ebf1Q07802 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ebf1Q07802 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ebf1Q07802 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ebf1Q07802 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ebf1Q07802 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ebf1Q07802 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ebf1Q07802 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ebf1Q07802 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ebf1Q07802 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ebf1Q07802 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ebf1Q07802 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ebf1Q07802 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ebf1Q07802 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ebf1Q07802 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ebf1Q07802 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ebf1Q07802 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ebf1Q07802 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ebf1Q07802 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ebf1Q07802 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ebf1Q07802 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ebf1Q07802 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ebf1Q07802 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ebf1Q07802 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ebf1Q07802 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ebf1Q07802 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ebf1Q07802 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ebf1Q07802 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ebf1Q07802 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ebf1Q07802 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ebf1Q07802 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ebf1Q07802 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ebf1Q07802 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ebf1Q07802 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ebf1Q07802 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ebf1Q07802 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ebf1Q07802 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ebf1Q07802 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ebf1Q07802 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ebf1Q07802 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ebf1Q07802 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ebf1Q07802 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ebf1Q07802 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms