Protein–RNA interactions for Protein: Q07424

Cdx4, Homeobox protein CDX-4, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdx4Q07424 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Cdx4Q07424 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cdx4Q07424 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms