Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Siah1bQ06985 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Siah1bQ06985 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Siah1bQ06985 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Siah1bQ06985 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Siah1bQ06985 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Siah1bQ06985 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Siah1bQ06985 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Siah1bQ06985 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Siah1bQ06985 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Siah1bQ06985 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Siah1bQ06985 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Siah1bQ06985 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Siah1bQ06985 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Siah1bQ06985 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Siah1bQ06985 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Siah1bQ06985 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Siah1bQ06985 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Siah1bQ06985 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Siah1bQ06985 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Siah1bQ06985 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Siah1bQ06985 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Siah1bQ06985 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Siah1bQ06985 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Siah1bQ06985 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Siah1bQ06985 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Siah1bQ06985 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Siah1bQ06985 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Siah1bQ06985 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Siah1bQ06985 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Siah1bQ06985 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Siah1bQ06985 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Siah1bQ06985 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Siah1bQ06985 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Siah1bQ06985 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Siah1bQ06985 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Siah1bQ06985 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Siah1bQ06985 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Siah1bQ06985 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Siah1bQ06985 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Siah1bQ06985 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Siah1bQ06985 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Siah1bQ06985 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Siah1bQ06985 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Siah1bQ06985 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Siah1bQ06985 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Siah1bQ06985 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Siah1bQ06985 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Siah1bQ06985 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Siah1bQ06985 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Siah1bQ06985 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Siah1bQ06985 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Siah1bQ06985 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Siah1bQ06985 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Siah1bQ06985 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Siah1bQ06985 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Siah1bQ06985 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Siah1bQ06985 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Siah1bQ06985 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Siah1bQ06985 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Siah1bQ06985 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Siah1bQ06985 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Siah1bQ06985 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Siah1bQ06985 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Siah1bQ06985 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Siah1bQ06985 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Siah1bQ06985 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Siah1bQ06985 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Siah1bQ06985 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Siah1bQ06985 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Siah1bQ06985 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Siah1bQ06985 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Siah1bQ06985 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Siah1bQ06985 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Siah1bQ06985 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Siah1bQ06985 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Siah1bQ06985 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Siah1bQ06985 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Siah1bQ06985 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Siah1bQ06985 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Siah1bQ06985 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Siah1bQ06985 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Siah1bQ06985 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Siah1bQ06985 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Siah1bQ06985 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Siah1bQ06985 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Siah1bQ06985 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Siah1bQ06985 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Siah1bQ06985 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Siah1bQ06985 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Siah1bQ06985 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Siah1bQ06985 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Siah1bQ06985 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Siah1bQ06985 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Siah1bQ06985 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Siah1bQ06985 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Siah1bQ06985 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Siah1bQ06985 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Siah1bQ06985 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Siah1bQ06985 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms