Protein–RNA interactions for Protein: Q06138

Cab39, Calcium-binding protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cab39Q06138 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cab39Q06138 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cab39Q06138 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cab39Q06138 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cab39Q06138 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cab39Q06138 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cab39Q06138 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cab39Q06138 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cab39Q06138 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cab39Q06138 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Cab39Q06138 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cab39Q06138 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cab39Q06138 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cab39Q06138 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Cab39Q06138 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Cab39Q06138 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cab39Q06138 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cab39Q06138 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cab39Q06138 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cab39Q06138 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cab39Q06138 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cab39Q06138 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cab39Q06138 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cab39Q06138 Atp8a1-201ENSMUST00000037380 8178 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cab39Q06138 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cab39Q06138 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cab39Q06138 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cab39Q06138 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cab39Q06138 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Cab39Q06138 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cab39Q06138 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cab39Q06138 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cab39Q06138 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cab39Q06138 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cab39Q06138 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cab39Q06138 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cab39Q06138 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cab39Q06138 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cab39Q06138 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cab39Q06138 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cab39Q06138 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cab39Q06138 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Cab39Q06138 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cab39Q06138 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cab39Q06138 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cab39Q06138 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cab39Q06138 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cab39Q06138 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cab39Q06138 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Cab39Q06138 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cab39Q06138 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cab39Q06138 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cab39Q06138 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cab39Q06138 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cab39Q06138 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cab39Q06138 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cab39Q06138 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cab39Q06138 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Cab39Q06138 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cab39Q06138 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cab39Q06138 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cab39Q06138 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cab39Q06138 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cab39Q06138 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cab39Q06138 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cab39Q06138 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cab39Q06138 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cab39Q06138 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cab39Q06138 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Cab39Q06138 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cab39Q06138 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cab39Q06138 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cab39Q06138 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cab39Q06138 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cab39Q06138 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cab39Q06138 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cab39Q06138 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cab39Q06138 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Cab39Q06138 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cab39Q06138 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cab39Q06138 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cab39Q06138 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cab39Q06138 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cab39Q06138 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cab39Q06138 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cab39Q06138 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cab39Q06138 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cab39Q06138 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Cab39Q06138 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cab39Q06138 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cab39Q06138 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cab39Q06138 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cab39Q06138 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cab39Q06138 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cab39Q06138 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cab39Q06138 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cab39Q06138 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cab39Q06138 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cab39Q06138 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Cab39Q06138 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms