Protein–RNA interactions for Protein: Q05895

Thbs3, Thrombospondin-3, mousemouse

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Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs3Q05895 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Thbs3Q05895 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Thbs3Q05895 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms