Protein–RNA interactions for Protein: Q03958

Pfdn6, Prefoldin subunit 6, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn6Q03958 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pfdn6Q03958 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pfdn6Q03958 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pfdn6Q03958 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pfdn6Q03958 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pfdn6Q03958 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pfdn6Q03958 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Pfdn6Q03958 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Pfdn6Q03958 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Pfdn6Q03958 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Pfdn6Q03958 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Pfdn6Q03958 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pfdn6Q03958 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pfdn6Q03958 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pfdn6Q03958 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pfdn6Q03958 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pfdn6Q03958 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pfdn6Q03958 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pfdn6Q03958 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pfdn6Q03958 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pfdn6Q03958 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pfdn6Q03958 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pfdn6Q03958 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pfdn6Q03958 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pfdn6Q03958 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Pfdn6Q03958 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Pfdn6Q03958 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Pfdn6Q03958 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pfdn6Q03958 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pfdn6Q03958 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pfdn6Q03958 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pfdn6Q03958 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Pfdn6Q03958 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Pfdn6Q03958 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pfdn6Q03958 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pfdn6Q03958 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pfdn6Q03958 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pfdn6Q03958 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pfdn6Q03958 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pfdn6Q03958 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Pfdn6Q03958 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pfdn6Q03958 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pfdn6Q03958 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pfdn6Q03958 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pfdn6Q03958 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pfdn6Q03958 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Pfdn6Q03958 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pfdn6Q03958 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Pfdn6Q03958 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Pfdn6Q03958 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pfdn6Q03958 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pfdn6Q03958 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Pfdn6Q03958 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pfdn6Q03958 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Pfdn6Q03958 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pfdn6Q03958 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pfdn6Q03958 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pfdn6Q03958 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pfdn6Q03958 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pfdn6Q03958 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pfdn6Q03958 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pfdn6Q03958 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pfdn6Q03958 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pfdn6Q03958 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pfdn6Q03958 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pfdn6Q03958 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pfdn6Q03958 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pfdn6Q03958 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pfdn6Q03958 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pfdn6Q03958 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pfdn6Q03958 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pfdn6Q03958 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pfdn6Q03958 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pfdn6Q03958 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pfdn6Q03958 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pfdn6Q03958 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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