Protein–RNA interactions for Protein: Q03172

Hivep1, Zinc finger protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 2,688 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hivep1Q03172 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Hivep1Q03172 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Hivep1Q03172 Cdk4-202ENSMUST00000120226 714 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hivep1Q03172 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Hivep1Q03172 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hivep1Q03172 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hivep1Q03172 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Hivep1Q03172 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hivep1Q03172 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hivep1Q03172 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hivep1Q03172 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hivep1Q03172 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hivep1Q03172 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hivep1Q03172 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hivep1Q03172 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hivep1Q03172 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hivep1Q03172 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hivep1Q03172 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hivep1Q03172 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Hivep1Q03172 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hivep1Q03172 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Hivep1Q03172 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Hivep1Q03172 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hivep1Q03172 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Hivep1Q03172 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hivep1Q03172 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hivep1Q03172 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hivep1Q03172 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hivep1Q03172 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hivep1Q03172 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hivep1Q03172 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Hivep1Q03172 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Hivep1Q03172 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hivep1Q03172 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hivep1Q03172 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hivep1Q03172 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hivep1Q03172 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hivep1Q03172 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hivep1Q03172 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hivep1Q03172 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hivep1Q03172 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hivep1Q03172 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hivep1Q03172 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hivep1Q03172 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
Hivep1Q03172 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hivep1Q03172 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hivep1Q03172 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hivep1Q03172 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Hivep1Q03172 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hivep1Q03172 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hivep1Q03172 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hivep1Q03172 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hivep1Q03172 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hivep1Q03172 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Hivep1Q03172 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hivep1Q03172 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hivep1Q03172 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Hivep1Q03172 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hivep1Q03172 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Hivep1Q03172 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Hivep1Q03172 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Hivep1Q03172 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hivep1Q03172 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Hivep1Q03172 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Hivep1Q03172 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hivep1Q03172 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hivep1Q03172 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hivep1Q03172 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hivep1Q03172 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hivep1Q03172 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hivep1Q03172 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hivep1Q03172 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hivep1Q03172 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hivep1Q03172 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hivep1Q03172 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hivep1Q03172 4933424N20Rik-201ENSMUST00000200749 1463 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Hivep1Q03172 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hivep1Q03172 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hivep1Q03172 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hivep1Q03172 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hivep1Q03172 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hivep1Q03172 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Hivep1Q03172 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Hivep1Q03172 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Hivep1Q03172 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hivep1Q03172 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hivep1Q03172 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hivep1Q03172 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hivep1Q03172 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Hivep1Q03172 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hivep1Q03172 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hivep1Q03172 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hivep1Q03172 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hivep1Q03172 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hivep1Q03172 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hivep1Q03172 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Hivep1Q03172 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Hivep1Q03172 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Hivep1Q03172 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Hivep1Q03172 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms