Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GscQ02591 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GscQ02591 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GscQ02591 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GscQ02591 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GscQ02591 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GscQ02591 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GscQ02591 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GscQ02591 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GscQ02591 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GscQ02591 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GscQ02591 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GscQ02591 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GscQ02591 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GscQ02591 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GscQ02591 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GscQ02591 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GscQ02591 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GscQ02591 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GscQ02591 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GscQ02591 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GscQ02591 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GscQ02591 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
GscQ02591 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GscQ02591 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GscQ02591 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GscQ02591 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GscQ02591 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GscQ02591 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
GscQ02591 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
GscQ02591 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GscQ02591 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GscQ02591 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GscQ02591 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GscQ02591 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GscQ02591 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
GscQ02591 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GscQ02591 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GscQ02591 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
GscQ02591 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GscQ02591 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GscQ02591 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GscQ02591 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GscQ02591 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GscQ02591 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
GscQ02591 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GscQ02591 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GscQ02591 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GscQ02591 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GscQ02591 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GscQ02591 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GscQ02591 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GscQ02591 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GscQ02591 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GscQ02591 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GscQ02591 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GscQ02591 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GscQ02591 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GscQ02591 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GscQ02591 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GscQ02591 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GscQ02591 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GscQ02591 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
GscQ02591 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GscQ02591 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GscQ02591 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GscQ02591 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GscQ02591 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GscQ02591 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
GscQ02591 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GscQ02591 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GscQ02591 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GscQ02591 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
GscQ02591 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
GscQ02591 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
GscQ02591 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GscQ02591 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GscQ02591 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
GscQ02591 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GscQ02591 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GscQ02591 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GscQ02591 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GscQ02591 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GscQ02591 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GscQ02591 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GscQ02591 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GscQ02591 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GscQ02591 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GscQ02591 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GscQ02591 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GscQ02591 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GscQ02591 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GscQ02591 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GscQ02591 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GscQ02591 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GscQ02591 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GscQ02591 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GscQ02591 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GscQ02591 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GscQ02591 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms