Protein–RNA interactions for Protein: Q01514

Gbp1, Guanylate-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp1Q01514 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gbp1Q01514 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gbp1Q01514 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gbp1Q01514 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gbp1Q01514 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Gbp1Q01514 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gbp1Q01514 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gbp1Q01514 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gbp1Q01514 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gbp1Q01514 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gbp1Q01514 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gbp1Q01514 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gbp1Q01514 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gbp1Q01514 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gbp1Q01514 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gbp1Q01514 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gbp1Q01514 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gbp1Q01514 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gbp1Q01514 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Gbp1Q01514 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gbp1Q01514 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gbp1Q01514 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gbp1Q01514 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gbp1Q01514 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gbp1Q01514 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Gbp1Q01514 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gbp1Q01514 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Gbp1Q01514 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Gbp1Q01514 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gbp1Q01514 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gbp1Q01514 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gbp1Q01514 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gbp1Q01514 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gbp1Q01514 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gbp1Q01514 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gbp1Q01514 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gbp1Q01514 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gbp1Q01514 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gbp1Q01514 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gbp1Q01514 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gbp1Q01514 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gbp1Q01514 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gbp1Q01514 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gbp1Q01514 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gbp1Q01514 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gbp1Q01514 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gbp1Q01514 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gbp1Q01514 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gbp1Q01514 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gbp1Q01514 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gbp1Q01514 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gbp1Q01514 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gbp1Q01514 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gbp1Q01514 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gbp1Q01514 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gbp1Q01514 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Gbp1Q01514 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gbp1Q01514 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gbp1Q01514 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gbp1Q01514 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gbp1Q01514 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gbp1Q01514 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gbp1Q01514 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gbp1Q01514 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gbp1Q01514 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gbp1Q01514 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gbp1Q01514 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gbp1Q01514 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gbp1Q01514 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gbp1Q01514 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gbp1Q01514 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Gbp1Q01514 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gbp1Q01514 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Gbp1Q01514 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Gbp1Q01514 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gbp1Q01514 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gbp1Q01514 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gbp1Q01514 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gbp1Q01514 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gbp1Q01514 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gbp1Q01514 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gbp1Q01514 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Gbp1Q01514 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gbp1Q01514 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gbp1Q01514 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gbp1Q01514 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gbp1Q01514 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gbp1Q01514 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gbp1Q01514 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gbp1Q01514 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gbp1Q01514 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gbp1Q01514 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gbp1Q01514 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gbp1Q01514 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gbp1Q01514 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gbp1Q01514 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Gbp1Q01514 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gbp1Q01514 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gbp1Q01514 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Gbp1Q01514 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.9 ms