Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PrcdQ00LT2 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms